64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1668 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  55.29 
 
 		 684 aa  703    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  100 
 
 		 689 aa  1376    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  52.62 
 
 		 707 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  53.06 
 
 		 707 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  55.8 
 
 		 710 aa  726    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  52.84 
 
 		 720 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  39.36 
 
 		 691 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  40.23 
 
 		 685 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  40.06 
 
 		 685 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  40.09 
 
 		 728 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.34 
 
 		 681 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  39.76 
 
 		 728 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.87 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.92 
 
 		 357 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  40.64 
 
 		 371 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.98 
 
 		 370 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.44 
 
 		 362 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.96 
 
 		 362 aa  223  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.9 
 
 		 364 aa  219  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.95 
 
 		 360 aa  218  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  29.63 
 
 		 845 aa  135  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  31.43 
 
 		 955 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  29 
 
 		 891 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  26.72 
 
 		 366 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  31.12 
 
 		 574 aa  105  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  31.25 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  29.54 
 
 		 560 aa  97.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.08 
 
 		 339 aa  90.9  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  27.94 
 
 		 340 aa  90.5  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  27.94 
 
 		 340 aa  90.5  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  26.98 
 
 		 339 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00720  hypothetical protein  23.75 
 
 		 305 aa  90.5  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000877673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0807  hypothetical protein  22.97 
 
 		 302 aa  90.5  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00370253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  27.3 
 
 		 340 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0587  hypothetical protein  21.57 
 
 		 303 aa  86.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0873705  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  25.79 
 
 		 339 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  28.16 
 
 		 346 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  26.57 
 
 		 957 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  27.76 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  28.22 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0114  hypothetical protein  20.13 
 
 		 302 aa  73.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0358289  hitchhiker  0.00078389 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  27.13 
 
 		 346 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0492  hypothetical protein  24.91 
 
 		 334 aa  73.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  27.85 
 
 		 346 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3630  dehydrogenase-like protein  24.2 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  0.352042 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  26.81 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  26.5 
 
 		 346 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  27.13 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0475  hypothetical protein  25.93 
 
 		 299 aa  69.7  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2025  hypothetical protein  24.5 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0375526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  25.16 
 
 		 959 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0149  hypothetical protein  24.16 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0567257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0112  hypothetical protein  22.44 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000282861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  25.16 
 
 		 956 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  26.81 
 
 		 346 aa  66.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2695  hypothetical protein  23.25 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  26.58 
 
 		 346 aa  62  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1511  hypothetical protein  23.2 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.850305  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1830  hypothetical protein  25.25 
 
 		 304 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.290615 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  27.87 
 
 		 191 aa  55.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  27.47 
 
 		 1466 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  27.47 
 
 		 1466 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2005  hypothetical protein  26.69 
 
 		 408 aa  47.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375654  normal  0.0926262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4755  hypothetical protein  25.08 
 
 		 408 aa  46.6  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.0689026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>