55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2534 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.45 
 
 		 339 aa  655    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  704    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  81.12 
 
 		 339 aa  599  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  81.66 
 
 		 340 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  80.18 
 
 		 340 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  81.66 
 
 		 340 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  73.29 
 
 		 341 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  63.17 
 
 		 346 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  62.87 
 
 		 346 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  62.91 
 
 		 346 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  64.99 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  62.91 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  62.91 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  63.2 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  62.57 
 
 		 346 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  62.31 
 
 		 346 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  63.33 
 
 		 191 aa  245  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07801  hypothetical protein  60.98 
 
 		 145 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.53 
 
 		 359 aa  126  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.32 
 
 		 371 aa  123  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.45 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.48 
 
 		 370 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.84 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.2 
 
 		 357 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.05 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.33 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.48 
 
 		 685 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.16 
 
 		 685 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  26.98 
 
 		 689 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  29.21 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  23.55 
 
 		 691 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.84 
 
 		 681 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  26.2 
 
 		 845 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  28.15 
 
 		 556 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  25 
 
 		 728 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  27.45 
 
 		 574 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  23.31 
 
 		 710 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  24.52 
 
 		 728 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  26.14 
 
 		 560 aa  69.7  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  24.28 
 
 		 684 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  24.05 
 
 		 707 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  24.05 
 
 		 707 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  23.17 
 
 		 720 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  20.77 
 
 		 956 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  21.36 
 
 		 959 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  28.35 
 
 		 957 aa  52.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  28.88 
 
 		 418 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  28.34 
 
 		 418 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  27.13 
 
 		 891 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  25.48 
 
 		 4101 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  27.2 
 
 		 955 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.95 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749249  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 250 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1855  glutamyl-tRNA reductase  29.08 
 
 		 418 aa  42.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>