75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0150 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  100 
 
 
360 aa  729    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  64.23 
 
 
362 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  65.91 
 
 
370 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  64.51 
 
 
359 aa  481  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  60.5 
 
 
357 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  63.38 
 
 
371 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  56.34 
 
 
364 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  56.02 
 
 
362 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.66 
 
 
691 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  45.58 
 
 
681 aa  295  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.44 
 
 
685 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  44.75 
 
 
728 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  44.75 
 
 
728 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.61 
 
 
685 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  37.5 
 
 
710 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  38.48 
 
 
684 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  38.23 
 
 
689 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  38.63 
 
 
720 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  37.53 
 
 
707 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  37.53 
 
 
707 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  35.11 
 
 
955 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  35.45 
 
 
574 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  33.99 
 
 
845 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  30.68 
 
 
366 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  34.48 
 
 
556 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  32.17 
 
 
560 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  26.84 
 
 
891 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  29.9 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  31.85 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.43 
 
 
339 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  29.15 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  28.25 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  28.25 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  32.08 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  29.87 
 
 
957 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  28.89 
 
 
346 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  27.94 
 
 
346 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  28.52 
 
 
346 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  27.57 
 
 
346 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  29.07 
 
 
346 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  28.52 
 
 
346 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  27.69 
 
 
959 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  27.69 
 
 
956 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  26.92 
 
 
346 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  28.52 
 
 
346 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  29.43 
 
 
346 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  30.81 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  25.76 
 
 
4101 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  27.02 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
266 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  31.58 
 
 
382 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6649  ectoine utilization protein EutC  34.25 
 
 
334 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  24.42 
 
 
432 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  33.8 
 
 
327 aa  46.2  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  33.8 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6019  ectoine utilization protein EutC  30.68 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  28.95 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  23.43 
 
 
431 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
247 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  28.33 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  23.83 
 
 
512 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26403  predicted protein  23.81 
 
 
621 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00293247  decreased coverage  0.00469523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  33.03 
 
 
443 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  31.51 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7138  short chain dehydrogenase  29 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  31.51 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.81 
 
 
266 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  26.75 
 
 
414 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
270 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  50 
 
 
342 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  50 
 
 
342 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  24.12 
 
 
434 aa  42.7  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
325 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>