More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 443 aa  870    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  61.73 
 
 		 438 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  54.02 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  54.55 
 
 		 455 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  54.78 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  54.08 
 
 		 447 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  54.08 
 
 		 447 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  54.08 
 
 		 447 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  52.76 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  51.94 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  54.38 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  52.79 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  52.4 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  53.01 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  47.36 
 
 		 477 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  45.79 
 
 		 501 aa  360  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  50.9 
 
 		 440 aa  355  7.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  50 
 
 		 448 aa  353  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  49.89 
 
 		 455 aa  352  7e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 		 455 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  46.64 
 
 		 476 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  43.34 
 
 		 473 aa  333  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  50 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  42.95 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  45.85 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  45.62 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  38.41 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.64 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 458 aa  253  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 464 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.19 
 
 		 454 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 443 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  35.8 
 
 		 434 aa  249  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  34.64 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  36.13 
 
 		 436 aa  245  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  32.16 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  35.75 
 
 		 434 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  31.32 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  35.13 
 
 		 443 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.13 
 
 		 441 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 443 aa  233  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  37.3 
 
 		 458 aa  233  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  36.05 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 434 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  34.27 
 
 		 421 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  35.1 
 
 		 442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  37.76 
 
 		 422 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 		 414 aa  223  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  30.54 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  37.95 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 444 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  29.41 
 
 		 441 aa  220  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  29.7 
 
 		 444 aa  220  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  29.7 
 
 		 444 aa  220  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  29.84 
 
 		 443 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  33.8 
 
 		 438 aa  216  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  35.51 
 
 		 425 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  32.35 
 
 		 450 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  34.63 
 
 		 440 aa  213  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  31.64 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  31.64 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  34.8 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  35.28 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  35.99 
 
 		 422 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  36.22 
 
 		 422 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.55 
 
 		 461 aa  210  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  35.16 
 
 		 426 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  32.64 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  34.33 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 420 aa  206  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  35.2 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  32.6 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  36.02 
 
 		 453 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  35.77 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  34.12 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 425 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.03 
 
 		 429 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  32.63 
 
 		 430 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 425 aa  199  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  31.74 
 
 		 464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1051  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00451156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  29.79 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  31.86 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  34.29 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  29.79 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  29.79 
 
 		 448 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  30.66 
 
 		 432 aa  196  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>