More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1100 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  81.27 
 
 
382 aa  651    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  80.21 
 
 
382 aa  637    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  81 
 
 
382 aa  644    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
379 aa  763    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  57.85 
 
 
383 aa  427  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  44.09 
 
 
449 aa  249  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  35.85 
 
 
423 aa  243  6e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  43.95 
 
 
411 aa  236  4e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  38.51 
 
 
434 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  35.28 
 
 
424 aa  233  6e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  33.95 
 
 
424 aa  231  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  35.38 
 
 
464 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.78 
 
 
434 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  40.06 
 
 
422 aa  227  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.22 
 
 
434 aa  225  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  34.61 
 
 
464 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 
421 aa  219  5e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  37.07 
 
 
434 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  35.8 
 
 
434 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  35.4 
 
 
425 aa  216  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  36.18 
 
 
436 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  35.31 
 
 
424 aa  209  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  36.89 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  35.26 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  31.74 
 
 
444 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 
441 aa  193  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  34.65 
 
 
436 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  34.73 
 
 
438 aa  191  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  33.84 
 
 
447 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 
446 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  33.8 
 
 
422 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  31.83 
 
 
457 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  33.05 
 
 
441 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 
442 aa  189  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.61 
 
 
442 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.99 
 
 
461 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  34.01 
 
 
425 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 
419 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  32.05 
 
 
418 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.57 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  29.23 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 
459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  32.65 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  37.01 
 
 
440 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  34.11 
 
 
420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  31.51 
 
 
418 aa  183  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  29.27 
 
 
443 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  30.22 
 
 
446 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  32.65 
 
 
422 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 
454 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  30.91 
 
 
421 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  33.23 
 
 
447 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  30.77 
 
 
419 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  30.53 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  33.05 
 
 
425 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 
425 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  32.36 
 
 
422 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 
425 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  30.49 
 
 
432 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  31.38 
 
 
426 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  33.24 
 
 
420 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  31.89 
 
 
426 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  33.05 
 
 
425 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 
424 aa  176  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  33.24 
 
 
443 aa  176  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  33.24 
 
 
443 aa  176  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  29.77 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  30.38 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 
450 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  30.38 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.14 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  31.2 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 
438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 
340 aa  173  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  34.45 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  32.83 
 
 
444 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  29 
 
 
422 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  29.69 
 
 
416 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  30.98 
 
 
432 aa  171  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 
428 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  29.87 
 
 
428 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  31.7 
 
 
434 aa  169  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  31.98 
 
 
416 aa  169  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  33.14 
 
 
418 aa  169  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  29.53 
 
 
436 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  30.83 
 
 
434 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  32.66 
 
 
439 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  30.17 
 
 
421 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 
432 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 
423 aa  169  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  29.28 
 
 
436 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 
425 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  29.56 
 
 
449 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  30.15 
 
 
418 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 
419 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  32.65 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  32.4 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  31.49 
 
 
420 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>