More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0360 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  85.25 
 
 		 434 aa  762    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  79.26 
 
 		 434 aa  732    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  82.42 
 
 		 434 aa  731    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  75.35 
 
 		 434 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  84.79 
 
 		 434 aa  759    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  75.65 
 
 		 436 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 434 aa  888    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  53.49 
 
 		 443 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  52.49 
 
 		 438 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  52.27 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  48.33 
 
 		 421 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  51.18 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  50.94 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  50.58 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  48.47 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  47.53 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  47.65 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  47.49 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  43.33 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  42.42 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  46.1 
 
 		 441 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  45.2 
 
 		 458 aa  362  6e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  43.41 
 
 		 443 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  44.55 
 
 		 418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  45.79 
 
 		 419 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  44.28 
 
 		 418 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  40.76 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  43.38 
 
 		 418 aa  349  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  43.79 
 
 		 421 aa  349  7e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  42.76 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  46.97 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  46.21 
 
 		 443 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  43.1 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 434 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 432 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 432 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  42.39 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  42.96 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  43.97 
 
 		 444 aa  339  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.28 
 
 		 429 aa  338  8e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  43.97 
 
 		 422 aa  338  9e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  42.73 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  42.73 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  45.23 
 
 		 416 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  44.74 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  42.73 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  42.38 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  44.66 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  41.23 
 
 		 422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  44.74 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  44.74 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  44.74 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  42.48 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  44.74 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  43.68 
 
 		 422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  45.23 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  43.94 
 
 		 426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.62 
 
 		 419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  43.91 
 
 		 422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  43.71 
 
 		 416 aa  335  7e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  44.99 
 
 		 416 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  42.06 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  43.16 
 
 		 426 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  44.74 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  42.33 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  43.71 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  42.09 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  43.84 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  43.76 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  42.66 
 
 		 443 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  41.86 
 
 		 432 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 429 aa  332  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  40.8 
 
 		 426 aa  331  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  41.37 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  42.89 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  41.97 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  42.65 
 
 		 444 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  42.65 
 
 		 444 aa  329  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  42.65 
 
 		 444 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  42.65 
 
 		 444 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  42.65 
 
 		 444 aa  328  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  42.42 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  44.15 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  41.73 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  39.06 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  44.15 
 
 		 425 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  41.09 
 
 		 446 aa  325  9e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  43.93 
 
 		 416 aa  325  9e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  40.56 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  41.47 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  43.28 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.65 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  44.39 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  43.75 
 
 		 418 aa  322  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>