More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6799 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 458 aa  925    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  44.52 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  46.6 
 
 		 434 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  45.2 
 
 		 434 aa  362  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  44.96 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  45.67 
 
 		 434 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  44.73 
 
 		 434 aa  360  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  44.5 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  42.02 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 438 aa  322  6e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  41.26 
 
 		 421 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  40.97 
 
 		 440 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  39.36 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  37.41 
 
 		 441 aa  306  6e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.41 
 
 		 461 aa  306  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  38.33 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  40.74 
 
 		 430 aa  300  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  38.05 
 
 		 464 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  41.94 
 
 		 446 aa  299  9e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  37.53 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  39.12 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  39.04 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  41.94 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  39.43 
 
 		 454 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  41.94 
 
 		 446 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  37.69 
 
 		 443 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  41.18 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  38.04 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  39.05 
 
 		 442 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  40.18 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  37.76 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  36.47 
 
 		 420 aa  286  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  39.34 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  37.7 
 
 		 444 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 444 aa  281  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  39.35 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  37.24 
 
 		 444 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  38.02 
 
 		 443 aa  279  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  40.14 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 418 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  37.38 
 
 		 416 aa  277  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 		 416 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 		 416 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 		 416 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 		 416 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  37.01 
 
 		 444 aa  276  8e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  37.01 
 
 		 444 aa  276  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  35.89 
 
 		 422 aa  276  8e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  37.13 
 
 		 416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  37.38 
 
 		 416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  37.38 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  37.38 
 
 		 416 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  35.36 
 
 		 420 aa  274  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  36.88 
 
 		 416 aa  274  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.14 
 
 		 423 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  37.13 
 
 		 416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  39.28 
 
 		 398 aa  273  5.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  36.63 
 
 		 416 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  36.39 
 
 		 416 aa  273  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 		 465 aa  271  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  37.75 
 
 		 424 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  37.3 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  36.53 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  37.67 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  36.87 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 420 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  37.8 
 
 		 419 aa  270  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  34.82 
 
 		 418 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 		 426 aa  269  8e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  36.63 
 
 		 416 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 428 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  37.05 
 
 		 446 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  36.6 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  38.33 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  39.15 
 
 		 455 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  38.33 
 
 		 422 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  36.41 
 
 		 425 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  35.51 
 
 		 418 aa  266  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  40.1 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  34.65 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  36.89 
 
 		 432 aa  265  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  36.63 
 
 		 426 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 		 416 aa  264  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  40.35 
 
 		 422 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  37.07 
 
 		 428 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  36.94 
 
 		 431 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  35.02 
 
 		 434 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.63 
 
 		 429 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  38.79 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1855  glutamyl-tRNA reductase  37.53 
 
 		 418 aa  262  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163682  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 434 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 434 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>