More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2642 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 420 aa  860    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  66.18 
 
 		 416 aa  578  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  64.1 
 
 		 416 aa  548  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  65.05 
 
 		 414 aa  548  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  60.38 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  60.14 
 
 		 428 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  59.06 
 
 		 429 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  61.88 
 
 		 450 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  59.15 
 
 		 432 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  59.81 
 
 		 432 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  60.94 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  59.57 
 
 		 432 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  60.56 
 
 		 435 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  58.82 
 
 		 432 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  59.34 
 
 		 432 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  60.56 
 
 		 435 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  59.57 
 
 		 432 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  59.22 
 
 		 418 aa  511  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  59.81 
 
 		 432 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  60.56 
 
 		 435 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  58.35 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  58.35 
 
 		 432 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  58.35 
 
 		 432 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  58.35 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  58.35 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  59.1 
 
 		 432 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  58.35 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  58.35 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0137  glutamyl-tRNA reductase  53.6 
 
 		 438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0618199  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0149  glutamyl-tRNA reductase  52.67 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.859015  normal  0.0610884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  54.09 
 
 		 423 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0776  glutamyl-tRNA reductase  53.86 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.163428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0781  glutamyl-tRNA reductase  54.35 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3663  glutamyl-tRNA reductase  53.68 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0851  glutamyl-tRNA reductase  54.11 
 
 		 426 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5475  glutamyl-tRNA reductase  54.14 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0852  glutamyl-tRNA reductase  53.41 
 
 		 436 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1553  glutamyl-tRNA reductase  54.31 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  52.76 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1281  glutamyl-tRNA reductase  57.07 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0524  glutamyl-tRNA reductase  54.18 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.534347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  52.3 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  52.3 
 
 		 422 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  50.38 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  51.45 
 
 		 439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  49.25 
 
 		 419 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  50.24 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  49.76 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  50.24 
 
 		 425 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  50 
 
 		 425 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  47.8 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  47.46 
 
 		 420 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  49.52 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  49.12 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  49.15 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  49.15 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  48.87 
 
 		 419 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  49.64 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  49.62 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  50.74 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  47.67 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  50.37 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  49.52 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  48.73 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  48.11 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  46.51 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  47.46 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  47.97 
 
 		 416 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  47.97 
 
 		 416 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  47.97 
 
 		 416 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  47.97 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  47.61 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  48.22 
 
 		 416 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  47.97 
 
 		 416 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  47.33 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  47.72 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  48.73 
 
 		 416 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  46.78 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  47.97 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  47.72 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  45.34 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  45.69 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  47.46 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  46.45 
 
 		 416 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  45.48 
 
 		 426 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  47.5 
 
 		 418 aa  361  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  46 
 
 		 420 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  45.75 
 
 		 418 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  45.75 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1855  glutamyl-tRNA reductase  47 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163682  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  43.52 
 
 		 418 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  43.52 
 
 		 418 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  43.52 
 
 		 418 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  43.52 
 
 		 418 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  45.25 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  45.25 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  43.28 
 
 		 418 aa  342  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  43.52 
 
 		 418 aa  342  7e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  43.52 
 
 		 418 aa  342  7e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>