More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1750 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
442 aa  906    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  61.05 
 
 
442 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  61.7 
 
 
440 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  59.36 
 
 
450 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  57.83 
 
 
443 aa  498  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  61.54 
 
 
430 aa  495  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 
434 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  48.83 
 
 
434 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  49.17 
 
 
434 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  47.6 
 
 
434 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  50.12 
 
 
436 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  48.47 
 
 
434 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  49.05 
 
 
461 aa  378  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  46.32 
 
 
443 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  49.06 
 
 
434 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  44.52 
 
 
438 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  44.5 
 
 
421 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  40.15 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  39.39 
 
 
458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  44.74 
 
 
420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  42.55 
 
 
425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  43.06 
 
 
436 aa  309  8e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  42.07 
 
 
464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.97 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 
464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  43.76 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  41.18 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  41.18 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  41.18 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  41.18 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  41.73 
 
 
432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  41.18 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  43.09 
 
 
436 aa  303  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  41.73 
 
 
432 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  41.48 
 
 
432 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  41.48 
 
 
432 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  41.23 
 
 
432 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  41.23 
 
 
432 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  37.56 
 
 
443 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  41.48 
 
 
432 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  41.48 
 
 
432 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  40.83 
 
 
428 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  39.12 
 
 
458 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  38.93 
 
 
426 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  40.34 
 
 
428 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  40.99 
 
 
432 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  42.37 
 
 
398 aa  296  4e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 
446 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  40.59 
 
 
429 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  44.8 
 
 
425 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  40.14 
 
 
422 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  42.76 
 
 
422 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  40.55 
 
 
454 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  40.74 
 
 
432 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  40.14 
 
 
420 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  42.99 
 
 
422 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  41.13 
 
 
443 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  37.91 
 
 
426 aa  292  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  40.89 
 
 
432 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  43.67 
 
 
425 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  39.05 
 
 
444 aa  290  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  40.81 
 
 
422 aa  289  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  41.6 
 
 
443 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  41.29 
 
 
440 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  41.6 
 
 
443 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  43.42 
 
 
425 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  43.67 
 
 
425 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  42.15 
 
 
426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  41.08 
 
 
424 aa  286  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  40.1 
 
 
416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  39.21 
 
 
423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  39.48 
 
 
443 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  40.95 
 
 
439 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  38.84 
 
 
444 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  39.19 
 
 
423 aa  280  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  38.84 
 
 
444 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  38.84 
 
 
444 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  42.54 
 
 
428 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  41.27 
 
 
422 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  38.84 
 
 
444 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  38.84 
 
 
444 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  38.6 
 
 
444 aa  279  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  38.6 
 
 
444 aa  279  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  38.82 
 
 
444 aa  279  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  38 
 
 
444 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  39.45 
 
 
420 aa  276  5e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  37.76 
 
 
425 aa  276  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  38.59 
 
 
426 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  39.85 
 
 
434 aa  275  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  42 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  42.25 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  38.42 
 
 
418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  41.79 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  42 
 
 
446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  39.71 
 
 
450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1426  glutamyl-tRNA reductase  38.93 
 
 
425 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 
425 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  41.69 
 
 
425 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3663  glutamyl-tRNA reductase  39.31 
 
 
432 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216962  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  40.51 
 
 
419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>