More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5179 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  79.86 
 
 		 428 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  79.86 
 
 		 428 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 428 aa  863    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  72.43 
 
 		 428 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  71.03 
 
 		 428 aa  629  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  73.41 
 
 		 432 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  68.19 
 
 		 438 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  68.16 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  51.28 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  50.69 
 
 		 441 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  50.46 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  50.81 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  49.2 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  49.2 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  50.34 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  50.7 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  48.39 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  44.34 
 
 		 512 aa  352  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26395  predicted protein  45.12 
 
 		 527 aa  348  9e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  42 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.14 
 
 		 464 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  40.19 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  39.62 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.65 
 
 		 434 aa  299  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.65 
 
 		 434 aa  299  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  38.24 
 
 		 441 aa  296  6e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  39.16 
 
 		 443 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  41.08 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  39.11 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  41.04 
 
 		 454 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  37.85 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  39.44 
 
 		 434 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  37.85 
 
 		 458 aa  285  7e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  37.12 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  37.2 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.3 
 
 		 461 aa  280  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  36.77 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  38.53 
 
 		 436 aa  276  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  36.07 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  36.07 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  36.07 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  36.07 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  36.07 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  35.83 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  35.83 
 
 		 444 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  34.97 
 
 		 444 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  36.07 
 
 		 444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  36.07 
 
 		 444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  38.41 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 458 aa  269  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.05 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  37.32 
 
 		 442 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 		 420 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  35.85 
 
 		 438 aa  264  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.38 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  38.23 
 
 		 420 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  36.47 
 
 		 414 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  38.12 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  38.12 
 
 		 425 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 421 aa  259  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  38.12 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  38.03 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  38.73 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  38.79 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  38.5 
 
 		 425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 422 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  37.65 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  37.09 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  37.65 
 
 		 422 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  37.65 
 
 		 422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  36.82 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  36.17 
 
 		 425 aa  252  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  36.71 
 
 		 443 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  35.85 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  37.3 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  36.24 
 
 		 440 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  34.29 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  35.88 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  35.7 
 
 		 446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  36.72 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  37.12 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  36.54 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  36.76 
 
 		 432 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  36.94 
 
 		 432 aa  243  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  36.52 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  33.99 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  33.99 
 
 		 432 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  34.75 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  33.99 
 
 		 432 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  34.75 
 
 		 431 aa  240  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 432 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  37.26 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  34.26 
 
 		 418 aa  239  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  34.22 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  36.83 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>