More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3699 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  86.68 
 
 
428 aa  768    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
428 aa  874    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  79.29 
 
 
432 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  72.9 
 
 
428 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  72.9 
 
 
428 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  72.43 
 
 
428 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  74.17 
 
 
431 aa  620  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  72.54 
 
 
438 aa  610  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  51.28 
 
 
436 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  50.23 
 
 
441 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  50.68 
 
 
441 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  50.81 
 
 
432 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  50.46 
 
 
435 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  50.81 
 
 
432 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 
436 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  49.53 
 
 
436 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  48.97 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  48.51 
 
 
435 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  45.58 
 
 
512 aa  361  1e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26395  predicted protein  47.67 
 
 
527 aa  360  3e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  41.03 
 
 
443 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  39.49 
 
 
464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  38.26 
 
 
434 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  38.39 
 
 
441 aa  297  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  38.26 
 
 
434 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  38.35 
 
 
464 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  39.48 
 
 
434 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  38.68 
 
 
434 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  38.73 
 
 
441 aa  290  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  38.86 
 
 
443 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.79 
 
 
461 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  39.3 
 
 
434 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 
443 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  39.11 
 
 
425 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  36.92 
 
 
436 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  40.89 
 
 
454 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  37.09 
 
 
458 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  38.88 
 
 
425 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  38.88 
 
 
425 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  38.86 
 
 
453 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 
434 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  38.21 
 
 
446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  38.17 
 
 
425 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.24 
 
 
429 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  38.17 
 
 
422 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  38.17 
 
 
422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  38.03 
 
 
428 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.6 
 
 
438 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  37.24 
 
 
426 aa  262  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  34.11 
 
 
444 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.03 
 
 
436 aa  261  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 
443 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  35.84 
 
 
444 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  35.84 
 
 
444 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  35.84 
 
 
444 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  37.74 
 
 
450 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  35.84 
 
 
444 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  35.84 
 
 
444 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  35.84 
 
 
444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  35.59 
 
 
444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 
444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 
444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  37.76 
 
 
425 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  36.71 
 
 
442 aa  259  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  37.76 
 
 
425 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  36.72 
 
 
442 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 
425 aa  257  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  35.89 
 
 
418 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 
430 aa  257  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  36.41 
 
 
436 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  36.2 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  35.78 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  36.34 
 
 
458 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  36.24 
 
 
440 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  35.43 
 
 
422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  35.89 
 
 
418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  34.2 
 
 
421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  35.4 
 
 
418 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  36.41 
 
 
419 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  35.73 
 
 
420 aa  250  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 
432 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 
443 aa  249  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 
432 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 
432 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  34.76 
 
 
449 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 
432 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  35.46 
 
 
414 aa  247  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 
464 aa  246  6.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  35.37 
 
 
419 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  33.82 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  34.58 
 
 
422 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  33.58 
 
 
432 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  36.47 
 
 
408 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  36.57 
 
 
418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  35.54 
 
 
434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  36.57 
 
 
418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>