More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0776 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 436 aa  872    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  85.71 
 
 		 435 aa  757    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  94.95 
 
 		 436 aa  836    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  94.95 
 
 		 436 aa  838    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  70.4 
 
 		 441 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  67.6 
 
 		 432 aa  599  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  67.13 
 
 		 432 aa  597  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  69.93 
 
 		 441 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  67.37 
 
 		 436 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  68.07 
 
 		 435 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  52.78 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  49.2 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  50.58 
 
 		 431 aa  408  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  49.08 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  47.59 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  47.59 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  48.14 
 
 		 428 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  38.67 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26395  predicted protein  39.37 
 
 		 527 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  38.89 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  38.04 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  39.86 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  38.22 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  39.37 
 
 		 434 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  36.84 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  38.93 
 
 		 434 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  37.76 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.39 
 
 		 461 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.93 
 
 		 434 aa  272  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  35.88 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  38.2 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  38.43 
 
 		 434 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  36.22 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  36.22 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  36.22 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  36.22 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  36.22 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  36.22 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  35.99 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  35.99 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  35.99 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  34.49 
 
 		 441 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  35.91 
 
 		 443 aa  259  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.42 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  34.61 
 
 		 458 aa  256  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  33.03 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34.26 
 
 		 443 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  34.98 
 
 		 458 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  35.78 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  34.05 
 
 		 414 aa  246  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  36.49 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 442 aa  243  7e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  34.63 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 450 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  36.01 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  33.96 
 
 		 422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 420 aa  236  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 419 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  34.49 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  31.8 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  34.26 
 
 		 422 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.64 
 
 		 429 aa  232  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  34.49 
 
 		 425 aa  232  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  34.26 
 
 		 425 aa  232  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  34.03 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 425 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 432 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 432 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 432 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  32.57 
 
 		 428 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  34.97 
 
 		 453 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  35.99 
 
 		 442 aa  229  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  35.78 
 
 		 450 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 432 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 429 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  34.26 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 432 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 432 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>