More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1254 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  71.53 
 
 		 441 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  87.27 
 
 		 432 aa  772    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 432 aa  870    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  81.63 
 
 		 436 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  71.99 
 
 		 441 aa  641    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  69.68 
 
 		 435 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  67.13 
 
 		 436 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  66.43 
 
 		 436 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  66.2 
 
 		 436 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  64.8 
 
 		 435 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  55.73 
 
 		 438 aa  448  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  51.51 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  51.51 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  50.81 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  50.58 
 
 		 428 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  51.16 
 
 		 431 aa  425  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  52.09 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  40.32 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26395  predicted protein  40.55 
 
 		 527 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  38.89 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  40.41 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  38.89 
 
 		 443 aa  296  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  39.73 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  40.23 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  40.58 
 
 		 434 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  38.57 
 
 		 464 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  39.49 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  37.18 
 
 		 443 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  39.26 
 
 		 434 aa  286  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  38.34 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  39.27 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.57 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  35.25 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  36.57 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  35.8 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  35.8 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  35.8 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  35.8 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  35.8 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  35.8 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  35.57 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.43 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  35.57 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.85 
 
 		 438 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  37.73 
 
 		 425 aa  262  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  35.1 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  35.12 
 
 		 443 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  35.1 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  35.1 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  34.48 
 
 		 458 aa  256  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 422 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  31.4 
 
 		 441 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  36.38 
 
 		 414 aa  252  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 453 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.07 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 458 aa  250  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  36.1 
 
 		 440 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  36.01 
 
 		 419 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 440 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  36.05 
 
 		 434 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  34.49 
 
 		 420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  37.14 
 
 		 422 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  36.61 
 
 		 442 aa  239  8e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  35.44 
 
 		 418 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  32.65 
 
 		 420 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  35.44 
 
 		 473 aa  237  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  35.37 
 
 		 450 aa  236  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  35.2 
 
 		 446 aa  235  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  33.87 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.01 
 
 		 429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  36.09 
 
 		 425 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  34.48 
 
 		 416 aa  233  6e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  33.8 
 
 		 436 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.02 
 
 		 423 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  35.86 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 414 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  35.19 
 
 		 425 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  35.16 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  35.86 
 
 		 425 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  37.15 
 
 		 432 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  36.09 
 
 		 425 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  32.26 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  34.54 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  34.78 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 416 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  35.55 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  32.69 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 432 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 432 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  35.02 
 
 		 448 aa  226  7e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  34.54 
 
 		 446 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  35.58 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>