More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_09941 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 435 aa  877    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  74.65 
 
 		 441 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  74.88 
 
 		 441 aa  651    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  71.56 
 
 		 436 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  69.68 
 
 		 432 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  68.29 
 
 		 432 aa  600  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  68.07 
 
 		 436 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  68.07 
 
 		 436 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  67.6 
 
 		 436 aa  587  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  68.07 
 
 		 435 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  50.46 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  50.46 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  53.36 
 
 		 438 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  50.46 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  48.39 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  49.43 
 
 		 428 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  50 
 
 		 431 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  48.97 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  40.88 
 
 		 512 aa  322  6e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26395  predicted protein  41.78 
 
 		 527 aa  313  4.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  39.08 
 
 		 434 aa  298  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  40.74 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 443 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  38.62 
 
 		 434 aa  289  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.87 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  38.39 
 
 		 434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  36.87 
 
 		 464 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  38.02 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.7 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  38.85 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.79 
 
 		 434 aa  278  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 		 443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  36.47 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.33 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.8 
 
 		 438 aa  263  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  36.34 
 
 		 446 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  35.88 
 
 		 454 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  36.3 
 
 		 425 aa  256  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  33.8 
 
 		 421 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  38.94 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  35.47 
 
 		 443 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  38.31 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 441 aa  251  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  35.99 
 
 		 436 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  36.09 
 
 		 443 aa  250  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  36.09 
 
 		 443 aa  250  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 444 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 		 422 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  34.77 
 
 		 444 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  36.52 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 444 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 444 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  34.62 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  38.29 
 
 		 442 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  35.86 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  37.07 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  37.68 
 
 		 418 aa  244  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 414 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  35.42 
 
 		 436 aa  242  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  33.89 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  34.07 
 
 		 416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 418 aa  239  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  35.1 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  35.44 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  34.23 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  34.87 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.49 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  34.72 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  34.72 
 
 		 425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  34.41 
 
 		 425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 420 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  34.42 
 
 		 446 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  35.43 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  35.7 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  34.47 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  34.26 
 
 		 425 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.27 
 
 		 429 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  33.01 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  36.08 
 
 		 418 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  32.95 
 
 		 451 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 		 418 aa  229  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  36.59 
 
 		 450 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 418 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 418 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 473 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  34.01 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 418 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>