More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2761 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 443 aa  899    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 443 aa  899    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  44.66 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  45.73 
 
 		 421 aa  345  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  45.93 
 
 		 439 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  47.47 
 
 		 418 aa  336  5e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  43.58 
 
 		 446 aa  335  7.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.31 
 
 		 423 aa  334  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.92 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  42.42 
 
 		 434 aa  332  9e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  42.14 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  42.42 
 
 		 434 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  44.05 
 
 		 419 aa  331  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  42.48 
 
 		 422 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  45.28 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  42.18 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  42.76 
 
 		 420 aa  329  7e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  43.13 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  44.2 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  44.79 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  42.48 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  45.8 
 
 		 416 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  38.57 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  44.55 
 
 		 432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  44.55 
 
 		 432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  44.31 
 
 		 432 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  44.55 
 
 		 432 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  44.31 
 
 		 432 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  43.26 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  44.78 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  43.23 
 
 		 443 aa  323  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  42.38 
 
 		 425 aa  322  6e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  44.53 
 
 		 429 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.51 
 
 		 419 aa  322  8e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  41.57 
 
 		 420 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  44.07 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  43.04 
 
 		 418 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  43.83 
 
 		 432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  42.95 
 
 		 438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  43.83 
 
 		 432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  43.58 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  43.83 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  43.83 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  43.83 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  43.83 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  43.83 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0149  glutamyl-tRNA reductase  41.51 
 
 		 449 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.859015  normal  0.0610884 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  41.38 
 
 		 418 aa  319  5e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  42.21 
 
 		 422 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  42.21 
 
 		 422 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  42.28 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  42.53 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  41.18 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0137  glutamyl-tRNA reductase  41.36 
 
 		 438 aa  317  4e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0618199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 418 aa  316  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  44.08 
 
 		 435 aa  316  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 418 aa  316  7e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 418 aa  316  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  41.77 
 
 		 418 aa  316  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 418 aa  315  8e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 418 aa  315  8e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 418 aa  315  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 418 aa  315  9e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  42 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  43.72 
 
 		 435 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  44.42 
 
 		 416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  44.16 
 
 		 416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  41.46 
 
 		 418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  43.65 
 
 		 416 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  42.42 
 
 		 434 aa  312  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  44.16 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  41.49 
 
 		 425 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  43.49 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  43.91 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  43.91 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 418 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 418 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  43.91 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 418 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  43.91 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 418 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  43.91 
 
 		 416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  43.91 
 
 		 416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  41.73 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  41.52 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  41.49 
 
 		 425 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  43.75 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  43.19 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  40.95 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  41.25 
 
 		 425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  41 
 
 		 421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  42.65 
 
 		 418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  42.96 
 
 		 408 aa  306  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  40.79 
 
 		 418 aa  305  7e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  42.65 
 
 		 414 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  40.95 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  43.65 
 
 		 416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0776  glutamyl-tRNA reductase  42.53 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.163428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>