More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3064 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 443 aa  903    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  54.42 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  54.91 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  54.52 
 
 		 434 aa  471  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  51.63 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  56.09 
 
 		 434 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  51.4 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  53.07 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  47.97 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  47.63 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  48.69 
 
 		 461 aa  388  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  44.13 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  47.15 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  44.52 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  44.81 
 
 		 436 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  48.47 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  48.46 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  43.53 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  42.69 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  46.32 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  46.26 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  47.79 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  46.33 
 
 		 454 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  42.42 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  41.09 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.71 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  43.68 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  43.22 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  40.2 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  42.39 
 
 		 420 aa  342  7e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  45.48 
 
 		 439 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  43.33 
 
 		 425 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  39.52 
 
 		 444 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  43.02 
 
 		 441 aa  332  7.000000000000001e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  42.56 
 
 		 436 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  43.59 
 
 		 440 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  42.86 
 
 		 432 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  42.45 
 
 		 446 aa  328  8e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  41.76 
 
 		 426 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  42.61 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  42.61 
 
 		 422 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  42.39 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 444 aa  326  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  40.7 
 
 		 422 aa  326  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 444 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  38.43 
 
 		 444 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 444 aa  325  9e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 444 aa  325  9e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 444 aa  325  9e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 444 aa  325  9e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  42.15 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  41.73 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  42.26 
 
 		 418 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  42.26 
 
 		 418 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  42.26 
 
 		 418 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  42.26 
 
 		 418 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  41.98 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  41.98 
 
 		 416 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  41.98 
 
 		 416 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  41.98 
 
 		 416 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  41.83 
 
 		 418 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  41.83 
 
 		 418 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  41.83 
 
 		 418 aa  323  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  41.83 
 
 		 418 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  42.33 
 
 		 418 aa  322  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  41.83 
 
 		 418 aa  322  7e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  41.83 
 
 		 418 aa  322  7e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  42.01 
 
 		 418 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  41.58 
 
 		 418 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  39.86 
 
 		 422 aa  322  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  39.52 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  41.58 
 
 		 418 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  41.73 
 
 		 416 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  42.57 
 
 		 418 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  41.58 
 
 		 418 aa  319  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  41.3 
 
 		 421 aa  319  7.999999999999999e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  40.37 
 
 		 446 aa  318  9e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  38.11 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  41.49 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  38.11 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  42.57 
 
 		 418 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  42 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  39.52 
 
 		 420 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  41.73 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  41.03 
 
 		 428 aa  316  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  41.28 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  41.48 
 
 		 416 aa  316  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  41.48 
 
 		 416 aa  315  9e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  41.48 
 
 		 416 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  39.16 
 
 		 419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  40.19 
 
 		 428 aa  313  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  40.09 
 
 		 432 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>