More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0870 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  79.69 
 
 		 443 aa  726    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 454 aa  920    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  69.29 
 
 		 444 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  69.52 
 
 		 444 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  69.52 
 
 		 444 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  69.52 
 
 		 444 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  69.52 
 
 		 444 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  69.52 
 
 		 444 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  69.76 
 
 		 444 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  69.52 
 
 		 444 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  69.29 
 
 		 443 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  69.29 
 
 		 444 aa  600  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  69.29 
 
 		 444 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  55.99 
 
 		 448 aa  481  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  55.99 
 
 		 448 aa  481  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  56.67 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  49.13 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  46.33 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  45.24 
 
 		 464 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  42.12 
 
 		 458 aa  359  5e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  43.2 
 
 		 438 aa  356  5e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  45.39 
 
 		 434 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  44.05 
 
 		 464 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  46.97 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  46.67 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  46.68 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  43.13 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  43.74 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  45.61 
 
 		 446 aa  333  5e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  40.95 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  42.43 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.19 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  43.53 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  44.18 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1703  glutamyl-tRNA reductase  39.63 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  40.53 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  41.26 
 
 		 420 aa  316  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 421 aa  312  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  41.78 
 
 		 436 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  39.53 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  40.8 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  38.83 
 
 		 450 aa  296  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  39.72 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  39.43 
 
 		 458 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  39.72 
 
 		 422 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  40.8 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  42.04 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  38.79 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  40.55 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  40.76 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  38.84 
 
 		 426 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  42.09 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  40 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  39.25 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  41.04 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  40.1 
 
 		 420 aa  286  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  37.94 
 
 		 446 aa  286  7e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  39.72 
 
 		 455 aa  286  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  40.3 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  39.24 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  39.81 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  40.3 
 
 		 425 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  40.3 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  39.55 
 
 		 425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  40.64 
 
 		 446 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  40.64 
 
 		 446 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  40.39 
 
 		 446 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  40.71 
 
 		 418 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  44.48 
 
 		 432 aa  282  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  41.14 
 
 		 438 aa  282  8.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  37.82 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  40.71 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  38.64 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  38.64 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  41.75 
 
 		 424 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  38.75 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  40.89 
 
 		 428 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  38.9 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  39.5 
 
 		 432 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  37.88 
 
 		 434 aa  280  6e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 428 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  39.5 
 
 		 432 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  39.5 
 
 		 432 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  39.5 
 
 		 432 aa  279  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  39.26 
 
 		 431 aa  279  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  38.23 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.76 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  44.21 
 
 		 421 aa  278  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  38.34 
 
 		 432 aa  277  3e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  41.22 
 
 		 416 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  39.85 
 
 		 416 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 428 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  42.9 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  42.3 
 
 		 439 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  40.46 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  40.46 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  40.46 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  40.46 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  39.25 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>