More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2164 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 464 aa  958    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  62.14 
 
 		 464 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  59.57 
 
 		 446 aa  502  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  54.42 
 
 		 436 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  53.05 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  49.88 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  43.79 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  44.76 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  42.2 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  43.16 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  43.53 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  43.16 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  46.5 
 
 		 443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  44.05 
 
 		 454 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  41.04 
 
 		 436 aa  346  6e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.54 
 
 		 461 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  41.29 
 
 		 421 aa  339  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  42.08 
 
 		 434 aa  339  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  41.59 
 
 		 450 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  43.97 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  40.32 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  41.55 
 
 		 442 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  40.6 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  41.35 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  41.96 
 
 		 444 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  41.96 
 
 		 444 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  38.37 
 
 		 446 aa  320  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  42.18 
 
 		 443 aa  320  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  39.22 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  41.49 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  41.49 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  41.49 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  41.49 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  41.49 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  41.49 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  41.26 
 
 		 444 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  40.25 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  40.19 
 
 		 428 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  39.01 
 
 		 430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  39.86 
 
 		 448 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  39.86 
 
 		 448 aa  308  9e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  39.49 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  41.88 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  37.85 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  37.85 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  39.29 
 
 		 426 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  39.45 
 
 		 422 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  38.53 
 
 		 428 aa  302  9e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  39.43 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  41.61 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  39.05 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  39.43 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.76 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  40.52 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  39.76 
 
 		 425 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  38.05 
 
 		 458 aa  300  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  38.9 
 
 		 436 aa  299  9e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  38.61 
 
 		 465 aa  297  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  39.76 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  40.15 
 
 		 419 aa  296  7e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  38.25 
 
 		 420 aa  295  9e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  38.43 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  40.14 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  38.89 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  39.41 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  39.29 
 
 		 425 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  39.29 
 
 		 425 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  38.4 
 
 		 418 aa  293  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.81 
 
 		 423 aa  292  9e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  37.97 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  39.03 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  39.59 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  37.91 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 418 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  39.36 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  39.16 
 
 		 425 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  39.05 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  38.85 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  36.67 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  36.87 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  41.19 
 
 		 439 aa  286  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  36.18 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 		 446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  39.52 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  40.38 
 
 		 416 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  38.43 
 
 		 432 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  39.39 
 
 		 420 aa  282  8.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  39.9 
 
 		 416 aa  282  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  40.14 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  38.29 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  37.87 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>