More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3644 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 421 aa  865    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  48.21 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  48.33 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  47.63 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  47.26 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  48.81 
 
 		 434 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  47.02 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  45.71 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  45.71 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  43.68 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  44.39 
 
 		 420 aa  360  4e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  45.26 
 
 		 440 aa  353  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  45.05 
 
 		 450 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.76 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  45.24 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  43.43 
 
 		 428 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  43.74 
 
 		 432 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  43.43 
 
 		 428 aa  342  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  43.84 
 
 		 442 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  44.6 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  43.5 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  43.5 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  43.5 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  41.29 
 
 		 464 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  44.05 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  43.03 
 
 		 432 aa  338  7e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  43.66 
 
 		 434 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  44.81 
 
 		 422 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  43.66 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  43.66 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  43.03 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  43.66 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  43.66 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  43.66 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  43.66 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  44.58 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  43.03 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  46.08 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  41.55 
 
 		 416 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  42.08 
 
 		 429 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  43.78 
 
 		 414 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  42.14 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  44.5 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.54 
 
 		 419 aa  333  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  44.29 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  42.79 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 464 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  44.29 
 
 		 425 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  40.33 
 
 		 458 aa  328  8e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  41.51 
 
 		 418 aa  328  9e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  44.05 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  43.56 
 
 		 416 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  38.9 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  41.23 
 
 		 420 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  44.06 
 
 		 416 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  42.42 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  43.83 
 
 		 421 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  44.05 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  44.06 
 
 		 416 aa  326  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  40.71 
 
 		 422 aa  326  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  43.81 
 
 		 416 aa  325  6e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  41.67 
 
 		 419 aa  326  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  41.04 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  44.06 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  44.52 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  42.57 
 
 		 422 aa  324  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  44.06 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  42.79 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  43.81 
 
 		 416 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  44.44 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  44.44 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  44.44 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  44.44 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.24 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  43.32 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  40.53 
 
 		 420 aa  323  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  41.26 
 
 		 458 aa  322  9.000000000000001e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  40.38 
 
 		 416 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  41.19 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  43.43 
 
 		 443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  43.56 
 
 		 416 aa  319  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 465 aa  319  7e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 418 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  41.52 
 
 		 449 aa  318  7.999999999999999e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  42.58 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  43.69 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  43.46 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  42.75 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  42.75 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  42.75 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  42.75 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  42.75 
 
 		 418 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  42.75 
 
 		 418 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  42.75 
 
 		 418 aa  316  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  42.75 
 
 		 418 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  42.04 
 
 		 416 aa  316  5e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.42 
 
 		 423 aa  315  8e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  43.63 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  42.86 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>