More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2564 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 436 aa  891    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  46.9 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  46.78 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  44.81 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  46.78 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  47.49 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  45.24 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  46.12 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  44.52 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  46.84 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  46.54 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  46.6 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  45.31 
 
 		 450 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  46.23 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.09 
 
 		 464 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  43.33 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  42.42 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  40.32 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  44.89 
 
 		 430 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  41.88 
 
 		 446 aa  333  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  43.06 
 
 		 442 aa  328  9e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  40.95 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  41.18 
 
 		 458 aa  326  4.0000000000000003e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  41.78 
 
 		 454 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  43.06 
 
 		 436 aa  325  9e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  41.45 
 
 		 443 aa  322  8e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.71 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  41.06 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  39.13 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  41.63 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  39.16 
 
 		 429 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  42.79 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  38.7 
 
 		 420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  38.66 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  42.54 
 
 		 446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  42.54 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  40.81 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  37.98 
 
 		 443 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  37.02 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  39.42 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  40.81 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  38.24 
 
 		 422 aa  295  9e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  39.71 
 
 		 418 aa  295  9e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  38.53 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  38.63 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  38.63 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  38.53 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  38.83 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  38.3 
 
 		 431 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  38.39 
 
 		 416 aa  293  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  39.34 
 
 		 422 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  38.61 
 
 		 416 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  38.95 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  38.44 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  40.65 
 
 		 414 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  38.43 
 
 		 425 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  36.93 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  37.9 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  38.05 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  38.44 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 422 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  38.05 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  38.05 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  38.05 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  37.41 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  38.35 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  38.01 
 
 		 418 aa  286  5.999999999999999e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  36.53 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 		 416 aa  286  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 444 aa  285  9e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  40.14 
 
 		 425 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  38.24 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.36 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  38.26 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  37.2 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  40.15 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  39.7 
 
 		 427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  37.8 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  36.72 
 
 		 432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  38.03 
 
 		 425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  37.56 
 
 		 416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  37.56 
 
 		 416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  37.79 
 
 		 425 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  36.49 
 
 		 432 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  37.56 
 
 		 416 aa  282  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  38.06 
 
 		 465 aa  282  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>