More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1979 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 422 aa  825    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  43.69 
 
 		 458 aa  342  9e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  42.86 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  41.35 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.87 
 
 		 464 aa  332  8e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  44.64 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  44.44 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  43.14 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  43.06 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  43.2 
 
 		 421 aa  315  8e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  45.78 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  38.99 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  42.72 
 
 		 440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  41.96 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  44.42 
 
 		 446 aa  306  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  41.43 
 
 		 434 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  40.94 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  40.53 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  43.15 
 
 		 442 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  40.23 
 
 		 430 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  41.46 
 
 		 420 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.44 
 
 		 461 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  40.73 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  42.09 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  40.89 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  43.8 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  41.22 
 
 		 422 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  41.22 
 
 		 422 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  41.02 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  42.82 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  39.1 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  40.81 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  38.57 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  40.49 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  40.49 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 420 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  41.73 
 
 		 424 aa  293  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 425 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  43.88 
 
 		 446 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  40.25 
 
 		 444 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  38.33 
 
 		 418 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  40.25 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  40.25 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  40.25 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  39.75 
 
 		 443 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  40.25 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  40.25 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.27 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  43.35 
 
 		 439 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  40.25 
 
 		 444 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  44.19 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  42.93 
 
 		 443 aa  289  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  42.93 
 
 		 443 aa  289  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  40.56 
 
 		 450 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  39.62 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  39.43 
 
 		 443 aa  286  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  39.81 
 
 		 421 aa  285  7e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  36.25 
 
 		 434 aa  285  7e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  39.38 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  39.66 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  40.1 
 
 		 444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  38.82 
 
 		 419 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  39.14 
 
 		 425 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  40.75 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  40.5 
 
 		 432 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  40.75 
 
 		 432 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  40.75 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  40.75 
 
 		 432 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.63 
 
 		 423 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 		 422 aa  280  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  40.75 
 
 		 432 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  40.75 
 
 		 432 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  39.16 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  40.45 
 
 		 408 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  38.57 
 
 		 416 aa  277  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 		 418 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 		 418 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 		 418 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 		 418 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  40.15 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  41.54 
 
 		 451 aa  276  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 446 aa  276  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  38.05 
 
 		 425 aa  275  8e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  39.8 
 
 		 420 aa  275  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  39.8 
 
 		 418 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  39.8 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  39.5 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  39.5 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  39.5 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  39.5 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  39.5 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  39.5 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  39.8 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0852  glutamyl-tRNA reductase  40.74 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  39.5 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  36.12 
 
 		 418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  39.55 
 
 		 418 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  40.15 
 
 		 416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  39.25 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>