More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0296 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  72.77 
 
 		 450 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 442 aa  901    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  82.03 
 
 		 440 aa  724    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  68.65 
 
 		 430 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  61.05 
 
 		 442 aa  532  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  60.54 
 
 		 443 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  52.69 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  51.64 
 
 		 434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  50.94 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  51.54 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  51.54 
 
 		 434 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  48.35 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  50.12 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  51.29 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  47.15 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  48.94 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  41.27 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  43.84 
 
 		 421 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  46.23 
 
 		 436 aa  339  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.7 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  41.55 
 
 		 464 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  39.18 
 
 		 443 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  42.07 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.35 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  43.06 
 
 		 398 aa  305  7e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  39.73 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  41.33 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  42.62 
 
 		 439 aa  303  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  40.97 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  43.15 
 
 		 422 aa  296  7e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  38.79 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  41.92 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  39.05 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  42.26 
 
 		 426 aa  292  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  36.58 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  39.52 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  41.37 
 
 		 421 aa  288  9e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  36.77 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  42.32 
 
 		 422 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  38.61 
 
 		 418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  38.85 
 
 		 418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  40.5 
 
 		 449 aa  285  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  41.84 
 
 		 422 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  42.61 
 
 		 425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  37.26 
 
 		 444 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  42.24 
 
 		 408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  41.21 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 444 aa  282  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  39.55 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  38.33 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  43.14 
 
 		 425 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  39.13 
 
 		 420 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  39.9 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  39.9 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  39.9 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  40.2 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  39.9 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  39.9 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  42.5 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  41.85 
 
 		 434 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  41.63 
 
 		 450 aa  280  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  37.96 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 432 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 432 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  40.83 
 
 		 428 aa  279  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  42.64 
 
 		 425 aa  279  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  37.59 
 
 		 416 aa  279  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 432 aa  279  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  37.73 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  37.73 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  41.69 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  41.69 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  43.28 
 
 		 425 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  37.96 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  37.96 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  37.96 
 
 		 444 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  37.96 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  38.93 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  37.96 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  35.99 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  35.99 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  39.71 
 
 		 432 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  36.7 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  38.69 
 
 		 428 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  39.42 
 
 		 429 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  39.71 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  39.71 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  40.85 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  43.03 
 
 		 425 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  39.45 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  37.74 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  39.45 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  40.6 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  40.6 
 
 		 446 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  42.64 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  36.21 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  37.14 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  38.84 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  38.84 
 
 		 435 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>