More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0685 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 398 aa  807    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  48.72 
 
 		 441 aa  325  7e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  43.89 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  43.06 
 
 		 442 aa  305  6e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  44.19 
 
 		 443 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  44.03 
 
 		 450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  44.09 
 
 		 434 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  42.01 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  44.03 
 
 		 434 aa  299  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  42.37 
 
 		 442 aa  296  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  42.94 
 
 		 434 aa  295  9e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  45.24 
 
 		 434 aa  292  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  44.13 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  42.65 
 
 		 434 aa  288  9e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  42.94 
 
 		 434 aa  288  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  43.6 
 
 		 421 aa  282  8.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  42.33 
 
 		 436 aa  279  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  41.43 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  43.23 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  42.9 
 
 		 454 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  42.9 
 
 		 443 aa  275  7e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  39.28 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  43.28 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  42.9 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  42.51 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  39.15 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  40.12 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  42.69 
 
 		 416 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.94 
 
 		 461 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  41.67 
 
 		 444 aa  266  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  42.99 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  41.64 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  42.99 
 
 		 416 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  39.32 
 
 		 418 aa  266  5.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  41.64 
 
 		 444 aa  265  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  41.64 
 
 		 444 aa  265  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  41.64 
 
 		 444 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  41.64 
 
 		 444 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  41.64 
 
 		 444 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  41.64 
 
 		 444 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  41.64 
 
 		 444 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  41.64 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  41.08 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 		 446 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  40.6 
 
 		 416 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  39.77 
 
 		 422 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  40.35 
 
 		 420 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  42.09 
 
 		 416 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  42.11 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  38.1 
 
 		 416 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  38.36 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  38.36 
 
 		 416 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  38.36 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  38.36 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  41.46 
 
 		 464 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  36.84 
 
 		 419 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  40.28 
 
 		 446 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  42.39 
 
 		 416 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.34 
 
 		 423 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  40 
 
 		 446 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  37.04 
 
 		 426 aa  256  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  39.72 
 
 		 446 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  40.6 
 
 		 416 aa  255  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  42.55 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  38.26 
 
 		 416 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  40.35 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  38.26 
 
 		 416 aa  253  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  40.51 
 
 		 464 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  41.19 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  38.08 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  41.79 
 
 		 428 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  35.91 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  41.19 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  36.75 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  41.49 
 
 		 425 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  41.19 
 
 		 425 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  41.19 
 
 		 425 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  38.53 
 
 		 414 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  40.42 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  40.42 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  36.78 
 
 		 426 aa  243  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  35.79 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  37.36 
 
 		 426 aa  242  7e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  40.29 
 
 		 436 aa  242  7.999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  36.62 
 
 		 418 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.98 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  40 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  39 
 
 		 434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  41.05 
 
 		 408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  39.27 
 
 		 431 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  37.54 
 
 		 420 aa  239  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  40.9 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  36.47 
 
 		 428 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  38.39 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  40.9 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  38.07 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  37.46 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0524  glutamyl-tRNA reductase  37.14 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.534347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  36.75 
 
 		 432 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  36.75 
 
 		 429 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>