More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1538 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  84.16 
 
 
425 aa  727    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
426 aa  875    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  85.82 
 
 
423 aa  739    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1426  glutamyl-tRNA reductase  83.69 
 
 
425 aa  723    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  83.92 
 
 
426 aa  748    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  87.32 
 
 
426 aa  759    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1795  glutamyl-tRNA reductase  84.87 
 
 
425 aa  735    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  40.79 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  39.81 
 
 
434 aa  330  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  39.58 
 
 
434 aa  329  6e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  39.58 
 
 
434 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  39.06 
 
 
434 aa  326  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  38.82 
 
 
434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 
430 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 
436 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  38.23 
 
 
443 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  36.92 
 
 
440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  38.93 
 
 
442 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  36.97 
 
 
450 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  36.58 
 
 
442 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  36.38 
 
 
438 aa  286  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  37.38 
 
 
443 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  35.62 
 
 
464 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.75 
 
 
461 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  34.91 
 
 
421 aa  276  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 
444 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  36 
 
 
443 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  35.7 
 
 
450 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 
458 aa  269  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  34.96 
 
 
434 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 
444 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 
444 aa  263  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  35.12 
 
 
422 aa  263  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
420 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 
454 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 
444 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 
444 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 
444 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 
444 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 
444 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  37.06 
 
 
464 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  35.51 
 
 
425 aa  260  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  34.57 
 
 
420 aa  260  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 
443 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  38.02 
 
 
441 aa  257  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 
440 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 
443 aa  257  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  34.89 
 
 
444 aa  256  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  34.89 
 
 
444 aa  256  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  32.62 
 
 
458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 
446 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 
432 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 
421 aa  250  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 
451 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 
432 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 
434 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 
432 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 
429 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 
434 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 
434 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 
434 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  35.36 
 
 
446 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 
434 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 
446 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 
419 aa  247  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  33.09 
 
 
443 aa  246  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  33.09 
 
 
443 aa  246  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 
432 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  34.06 
 
 
435 aa  246  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 
432 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 
434 aa  245  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  32.38 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  33.67 
 
 
422 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  34.06 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.59 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  31.68 
 
 
418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 
416 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 
416 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 
416 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 
416 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  35.09 
 
 
414 aa  243  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  37.36 
 
 
398 aa  242  7.999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  33.99 
 
 
435 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 
422 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 
432 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  35.84 
 
 
426 aa  242  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  34.11 
 
 
420 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  32.51 
 
 
428 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  34.83 
 
 
436 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 
432 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  31.67 
 
 
418 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  32.71 
 
 
422 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  34.73 
 
 
416 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  31.85 
 
 
418 aa  240  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 
425 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  35.43 
 
 
416 aa  240  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>