More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2071 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 473 aa  918    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  40.13 
 
 		 464 aa  315  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  38.6 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32.61 
 
 		 464 aa  279  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  33.95 
 
 		 464 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  37.3 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  34.26 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.37 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 		 465 aa  262  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  35.96 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.81 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  34.19 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 434 aa  257  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  39.34 
 
 		 422 aa  256  9e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  34.8 
 
 		 434 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.8 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  38.39 
 
 		 440 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  34.03 
 
 		 420 aa  249  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 434 aa  249  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 434 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.44 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  35.03 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  34.81 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  35.6 
 
 		 454 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  34.55 
 
 		 422 aa  246  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  31.55 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  35.28 
 
 		 420 aa  243  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  34.17 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  36.77 
 
 		 432 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  34.74 
 
 		 451 aa  240  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  34.47 
 
 		 436 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  37.95 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  35.57 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  33.11 
 
 		 428 aa  237  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  35.12 
 
 		 434 aa  237  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  38.85 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  36.43 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.5 
 
 		 429 aa  236  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  35.35 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 		 418 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  41.23 
 
 		 438 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  32.95 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  35.44 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 434 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  31.79 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 		 418 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 432 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  35.87 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 432 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  35.28 
 
 		 432 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 432 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  38.28 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  35.15 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  36.1 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  37.84 
 
 		 435 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  35.12 
 
 		 418 aa  233  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  38.05 
 
 		 446 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  34.09 
 
 		 436 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 448 aa  233  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 448 aa  233  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 		 420 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  35.87 
 
 		 432 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  35.87 
 
 		 432 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  35.87 
 
 		 432 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  38.32 
 
 		 446 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 428 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 442 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  35.87 
 
 		 432 aa  232  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  32.26 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  35.35 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  39.63 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  37.63 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  37.84 
 
 		 455 aa  230  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 		 432 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 		 444 aa  229  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  36 
 
 		 423 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 		 416 aa  229  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 		 432 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  34.62 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  35.87 
 
 		 430 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>