More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_26395 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009365  OSTLU_26395  predicted protein  100 
 
 		 527 aa  1077    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  47.78 
 
 		 428 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  47.67 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  45.58 
 
 		 432 aa  363  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  45.12 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  47.42 
 
 		 431 aa  361  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  44.72 
 
 		 428 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  44.72 
 
 		 428 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  46.84 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  43.1 
 
 		 512 aa  342  7e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  41.78 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  42.07 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  41.28 
 
 		 432 aa  326  7e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  40.37 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  39.22 
 
 		 436 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  39.37 
 
 		 436 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  38.69 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  39.68 
 
 		 441 aa  316  8e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  39.64 
 
 		 435 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  40.55 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  35.12 
 
 		 443 aa  253  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  34.15 
 
 		 464 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  34.39 
 
 		 464 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34.17 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  35.62 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 441 aa  232  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 434 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  34.03 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  34.15 
 
 		 419 aa  228  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  35.94 
 
 		 436 aa  227  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  33.81 
 
 		 418 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  33.91 
 
 		 418 aa  226  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  34.2 
 
 		 418 aa  226  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  32.56 
 
 		 416 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  34.47 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  34.75 
 
 		 440 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 		 458 aa  223  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  34.4 
 
 		 443 aa  223  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  34.4 
 
 		 443 aa  223  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  32.6 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 432 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 432 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 432 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  34.95 
 
 		 434 aa  220  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 432 aa  220  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 435 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  31.93 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  34.09 
 
 		 453 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 		 435 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  33.66 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  32.08 
 
 		 432 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  36.59 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  34.33 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  31.83 
 
 		 421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  31.88 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.76 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 		 424 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 434 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 434 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 434 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 434 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  31.68 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  31.74 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  31.83 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  34.25 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.69 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  31.97 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  31.81 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  31.58 
 
 		 420 aa  211  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  31.75 
 
 		 428 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.99 
 
 		 419 aa  210  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  32.13 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  31.98 
 
 		 425 aa  210  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  31.01 
 
 		 438 aa  209  9e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.58 
 
 		 423 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  31.88 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>