More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11600 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 464 aa  959    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  40.13 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 		 443 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  34.88 
 
 		 464 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 		 434 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 		 434 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 		 434 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 		 434 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 		 432 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 		 432 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 		 434 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  34.88 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  36.6 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  36.6 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  36.84 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  36.6 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  36.6 
 
 		 432 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 432 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 428 aa  246  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.65 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  35.89 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  34.99 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 		 432 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  33.8 
 
 		 440 aa  240  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  34.91 
 
 		 416 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  35.17 
 
 		 429 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  35.03 
 
 		 436 aa  239  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.07 
 
 		 441 aa  239  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  35.18 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  35.42 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  37.24 
 
 		 422 aa  237  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 442 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  35.2 
 
 		 434 aa  236  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  35.59 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  34.03 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  37.91 
 
 		 414 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  35.85 
 
 		 423 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  31.55 
 
 		 428 aa  233  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  34.11 
 
 		 434 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  34.74 
 
 		 416 aa  233  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 424 aa  232  9e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 418 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.71 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  31 
 
 		 432 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  34.01 
 
 		 442 aa  229  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  35.84 
 
 		 435 aa  229  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 426 aa  229  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 		 443 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  36.8 
 
 		 454 aa  229  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  35.59 
 
 		 450 aa  229  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  36.85 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  31.09 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  34.64 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  32.77 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  35.59 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 		 435 aa  223  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 		 421 aa  223  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 419 aa  223  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.03 
 
 		 429 aa  223  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  36.06 
 
 		 435 aa  222  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  32.45 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  32.52 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  32.33 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  31.31 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.92 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  32.08 
 
 		 438 aa  219  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0851  glutamyl-tRNA reductase  34.41 
 
 		 426 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307966  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  32.61 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 		 425 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  32.61 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  32.09 
 
 		 418 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  33.66 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  31.63 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  33.66 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  33.91 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0149  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.859015  normal  0.0610884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1553  glutamyl-tRNA reductase  34.87 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  30.7 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  33.91 
 
 		 444 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  33.09 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  33.09 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  33.09 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  33 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  33.09 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  30.7 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  34.17 
 
 		 440 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  31.32 
 
 		 431 aa  217  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>