More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1236 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 448 aa  909    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  85.04 
 
 		 448 aa  766    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  85.04 
 
 		 448 aa  766    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  57.38 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  56.67 
 
 		 454 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  54.26 
 
 		 444 aa  485  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  54.26 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  54.26 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  54.26 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  54.48 
 
 		 444 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  54.26 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  54.26 
 
 		 444 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  53.59 
 
 		 444 aa  481  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  53.59 
 
 		 444 aa  481  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  54.98 
 
 		 444 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  54.14 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  39.41 
 
 		 464 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  38.57 
 
 		 451 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  40 
 
 		 464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1703  glutamyl-tRNA reductase  39.57 
 
 		 421 aa  318  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  39.59 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  37.64 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  37.74 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  36.72 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  36.41 
 
 		 443 aa  279  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  36.9 
 
 		 434 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  36.77 
 
 		 446 aa  272  7e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  36 
 
 		 422 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 		 434 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  35.76 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  35.75 
 
 		 434 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  37.21 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  36.3 
 
 		 436 aa  265  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  34.88 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  35.28 
 
 		 426 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  35.25 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  38.11 
 
 		 422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  36.97 
 
 		 425 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  36.58 
 
 		 428 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  37.2 
 
 		 425 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  36.04 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.5 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  35.97 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  35.56 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 436 aa  256  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  35.8 
 
 		 425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 		 420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  36.1 
 
 		 443 aa  252  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  36.1 
 
 		 443 aa  252  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  35.17 
 
 		 430 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.61 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  35.24 
 
 		 432 aa  249  6e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  35.02 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  34.97 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.49 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  34.94 
 
 		 422 aa  247  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  37.22 
 
 		 418 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  35.18 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 436 aa  243  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  36.96 
 
 		 418 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  32.95 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  37.85 
 
 		 432 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  34.15 
 
 		 424 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 458 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  34.19 
 
 		 428 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  34.19 
 
 		 428 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  35.04 
 
 		 420 aa  239  8e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  34.84 
 
 		 441 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  34.84 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  34.64 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  37.22 
 
 		 449 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 		 440 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  34.83 
 
 		 442 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  35.88 
 
 		 418 aa  237  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  34.62 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  34.82 
 
 		 414 aa  236  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  35.7 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  31.93 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.13 
 
 		 419 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  32.29 
 
 		 440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  33.94 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 450 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  39.2 
 
 		 416 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  33.8 
 
 		 435 aa  232  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 		 413 aa  232  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 		 431 aa  232  9e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  34.17 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  34.58 
 
 		 443 aa  230  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 436 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 		 453 aa  230  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>