More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1764 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  85.04 
 
 
448 aa  743    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
448 aa  911    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
448 aa  911    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  57.01 
 
 
443 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  55.99 
 
 
454 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  52.69 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  52.69 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  52.91 
 
 
444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  52.69 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  52.69 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  52.69 
 
 
444 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  52.69 
 
 
444 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  52.47 
 
 
444 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  52.47 
 
 
444 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  54.03 
 
 
444 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  54.03 
 
 
443 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  39.21 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  39.86 
 
 
464 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  40.59 
 
 
458 aa  319  6e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.28 
 
 
464 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1703  glutamyl-tRNA reductase  39.72 
 
 
421 aa  311  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  39.1 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  41.37 
 
 
441 aa  298  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  39.86 
 
 
446 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  37.26 
 
 
438 aa  293  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  36.49 
 
 
434 aa  279  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  37.38 
 
 
434 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.59 
 
 
434 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  37.62 
 
 
434 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  36.9 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  35.07 
 
 
421 aa  274  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  37.03 
 
 
422 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 
422 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  36.28 
 
 
426 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.03 
 
 
436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  39.9 
 
 
422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.44 
 
 
461 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  36.85 
 
 
434 aa  264  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  37.65 
 
 
425 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 
420 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  37.65 
 
 
425 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 
436 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  34.93 
 
 
441 aa  257  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  37.05 
 
 
428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  36.69 
 
 
425 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 
430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  36.45 
 
 
425 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  37.18 
 
 
442 aa  253  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  36.21 
 
 
425 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  35.97 
 
 
425 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.92 
 
 
423 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.4 
 
 
419 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.44 
 
 
429 aa  249  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  36.01 
 
 
443 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  36.01 
 
 
443 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  37.53 
 
 
418 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  34.01 
 
 
440 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 
450 aa  246  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  37.53 
 
 
418 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 
449 aa  244  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  34.81 
 
 
420 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 
432 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  34.85 
 
 
442 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  38.58 
 
 
432 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  36.2 
 
 
419 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 
440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  34.85 
 
 
418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 
440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  35.87 
 
 
425 aa  240  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  34.76 
 
 
422 aa  240  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 
414 aa  240  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  35.14 
 
 
424 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 
429 aa  239  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  32.63 
 
 
435 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  34.59 
 
 
432 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 
428 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  36.2 
 
 
418 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 
458 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 
446 aa  237  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  34.34 
 
 
432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  34.59 
 
 
432 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  34.34 
 
 
432 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  34.34 
 
 
432 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  34.19 
 
 
428 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  36.96 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  33.79 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  33.03 
 
 
432 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  34.74 
 
 
428 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  34.74 
 
 
428 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 
436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 
431 aa  233  8.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  34.33 
 
 
432 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  37.66 
 
 
416 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 
441 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 
441 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 
428 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  39.19 
 
 
398 aa  231  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 
421 aa  230  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  34.76 
 
 
418 aa  230  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>