More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1296 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 425 aa  872    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  37.79 
 
 		 434 aa  288  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  36.08 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.03 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.03 
 
 		 434 aa  275  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  37.41 
 
 		 443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  36 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  37.67 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  34.82 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  35.76 
 
 		 436 aa  264  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  35.85 
 
 		 434 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  36.04 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  35.87 
 
 		 438 aa  259  8e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  34.83 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  35.41 
 
 		 418 aa  256  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.62 
 
 		 464 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  36.38 
 
 		 421 aa  253  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 		 422 aa  253  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  35.85 
 
 		 440 aa  247  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  36.97 
 
 		 464 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  34.38 
 
 		 443 aa  245  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.43 
 
 		 461 aa  245  9e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 419 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  36.02 
 
 		 449 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 		 442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 432 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  32.53 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 424 aa  239  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  36.15 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  34.62 
 
 		 429 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 446 aa  236  8e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  31.88 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  34.47 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  35.78 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  36.09 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 432 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  32.05 
 
 		 418 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 426 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 416 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  34.06 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  33.67 
 
 		 420 aa  233  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  34.74 
 
 		 425 aa  233  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 443 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 426 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  34.14 
 
 		 428 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 		 416 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  31.88 
 
 		 416 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 444 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 		 416 aa  232  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  34.83 
 
 		 427 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  34.64 
 
 		 434 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  32.95 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  34.13 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  34.28 
 
 		 432 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 		 416 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  31.88 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  31.88 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  31.88 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  31.88 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 416 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  30.49 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  31.64 
 
 		 416 aa  231  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  33.83 
 
 		 443 aa  230  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  34.32 
 
 		 432 aa  229  9e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 425 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  34.32 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  34.22 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  33.01 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  31.64 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 422 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 		 425 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 465 aa  226  7e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>