More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0091 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 340 aa  701    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  44.61 
 
 		 436 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  41.49 
 
 		 464 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.12 
 
 		 464 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  43.88 
 
 		 441 aa  255  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  40.12 
 
 		 440 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  41.32 
 
 		 443 aa  252  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  40.72 
 
 		 443 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  38.92 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  43.37 
 
 		 446 aa  249  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  39.34 
 
 		 436 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.91 
 
 		 434 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.61 
 
 		 434 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  38.51 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  38.28 
 
 		 458 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  39.02 
 
 		 450 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  37.99 
 
 		 442 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  41.18 
 
 		 443 aa  238  8e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  38.04 
 
 		 442 aa  238  8e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  38.53 
 
 		 430 aa  238  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  37.43 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  38.77 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  38.02 
 
 		 446 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  40.96 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.74 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  39.04 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  36.7 
 
 		 438 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.01 
 
 		 429 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  36.53 
 
 		 420 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  38.34 
 
 		 440 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  38.08 
 
 		 446 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  37.65 
 
 		 398 aa  229  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  38.08 
 
 		 446 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  36.67 
 
 		 446 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 		 443 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  37.24 
 
 		 454 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 441 aa  226  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  36.86 
 
 		 436 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  39.55 
 
 		 461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  39.94 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  36.04 
 
 		 420 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 422 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  37.2 
 
 		 420 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 422 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  36.97 
 
 		 416 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2088  glutamyl-tRNA reductase  37.69 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  40.69 
 
 		 449 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 		 425 aa  219  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  37.01 
 
 		 418 aa  219  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  35.95 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  36.9 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  36.34 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  36.59 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  36.59 
 
 		 416 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  36.59 
 
 		 416 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  36.59 
 
 		 416 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  36.59 
 
 		 416 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  36.61 
 
 		 416 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  37 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  38.07 
 
 		 427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  36.59 
 
 		 416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  36.61 
 
 		 416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  37.43 
 
 		 418 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  37.43 
 
 		 418 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  37.43 
 
 		 418 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  37.43 
 
 		 418 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  37.43 
 
 		 418 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  37.43 
 
 		 418 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  37.43 
 
 		 418 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  37.43 
 
 		 418 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  36.62 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  36.94 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  34.86 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  35.99 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 432 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 432 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  36.83 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  36.83 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  36.83 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  36.83 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  38.26 
 
 		 408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  35.58 
 
 		 416 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.62 
 
 		 419 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  35.57 
 
 		 429 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  34.53 
 
 		 422 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  36.23 
 
 		 424 aa  212  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  35.19 
 
 		 431 aa  212  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  37.13 
 
 		 418 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  35.54 
 
 		 432 aa  212  9e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 		 432 aa  212  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  35.28 
 
 		 428 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  34.82 
 
 		 458 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>