More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2825 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
438 aa  849    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  55.86 
 
 
447 aa  429  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  55.97 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  53.32 
 
 
457 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  54.35 
 
 
447 aa  390  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  37.83 
 
 
449 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  38.01 
 
 
422 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  38.54 
 
 
411 aa  232  9e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  34.73 
 
 
379 aa  193  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  33.85 
 
 
422 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  32.24 
 
 
383 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  33.13 
 
 
382 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  33.14 
 
 
382 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  37.33 
 
 
422 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  32.25 
 
 
382 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 
443 aa  183  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  32.38 
 
 
431 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  32.38 
 
 
413 aa  182  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 
428 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  30.33 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  32.16 
 
 
431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  32.82 
 
 
423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  33.15 
 
 
432 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  30.26 
 
 
428 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 
424 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  34.58 
 
 
441 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  34.91 
 
 
424 aa  179  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 
441 aa  179  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  31.38 
 
 
432 aa  179  9e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  31.82 
 
 
464 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  32.8 
 
 
420 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  33.07 
 
 
425 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  33.67 
 
 
421 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 
454 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  31.68 
 
 
436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  32.02 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 
436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  32.24 
 
 
434 aa  173  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  34.69 
 
 
446 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  32.77 
 
 
440 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  30.97 
 
 
443 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  30.08 
 
 
436 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  30.87 
 
 
428 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  30.87 
 
 
428 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  30.35 
 
 
436 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  30.36 
 
 
436 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  31.5 
 
 
414 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  30.05 
 
 
458 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  34.18 
 
 
446 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  30.55 
 
 
444 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  32.58 
 
 
425 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  28.77 
 
 
441 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  34.06 
 
 
428 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  34.18 
 
 
446 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  30.05 
 
 
464 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  30.39 
 
 
420 aa  171  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  30.55 
 
 
444 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  30.55 
 
 
444 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  30.55 
 
 
444 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  30.55 
 
 
444 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
422 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  29.81 
 
 
436 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 
432 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  30.39 
 
 
444 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  30.33 
 
 
444 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  33.51 
 
 
418 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  30.55 
 
 
444 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 
441 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 
434 aa  169  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 
440 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  31.49 
 
 
434 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  34.03 
 
 
408 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  31.45 
 
 
434 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  30.96 
 
 
424 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  32.98 
 
 
418 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  30.57 
 
 
438 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 
422 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  30.81 
 
 
443 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  32.72 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  34.38 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  35.64 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  33 
 
 
425 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 
449 aa  167  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 
421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  32.99 
 
 
425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  32.72 
 
 
432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  32.02 
 
 
432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  29.95 
 
 
434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  32.72 
 
 
432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 
432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  32.72 
 
 
432 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  32.72 
 
 
432 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  32.32 
 
 
425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  33.15 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  29.78 
 
 
443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  34.11 
 
 
428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  29.72 
 
 
435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  29.72 
 
 
444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>