More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0980 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 423 aa  844    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  64.62 
 
 		 424 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  60.58 
 
 		 425 aa  490  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  57.38 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  49.53 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  41.16 
 
 		 449 aa  279  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  42.94 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  38.35 
 
 		 411 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  36.84 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  36.27 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  36.56 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  36.39 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  35.85 
 
 		 379 aa  243  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  32.59 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  36.98 
 
 		 446 aa  233  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.3 
 
 		 441 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  32.61 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  33.66 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  33.24 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  34.97 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  33.66 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.27 
 
 		 436 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  35.06 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  34 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  34.32 
 
 		 418 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  36.54 
 
 		 453 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 419 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  34.08 
 
 		 440 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  34.4 
 
 		 419 aa  202  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.22 
 
 		 434 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  37.13 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  32.59 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.22 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  29.56 
 
 		 421 aa  199  6e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  36.39 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  31.97 
 
 		 436 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  32.38 
 
 		 443 aa  196  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  36.24 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  33.58 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  35.14 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  35.73 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  34.15 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  31.54 
 
 		 428 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 425 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 		 446 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  32.45 
 
 		 432 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 425 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 416 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 432 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 432 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 416 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 434 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 416 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  31.45 
 
 		 459 aa  189  9e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 416 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.04 
 
 		 461 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  30.84 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  33.96 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  33.82 
 
 		 428 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  33.83 
 
 		 416 aa  186  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  31.27 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  32.26 
 
 		 442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  30.34 
 
 		 418 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  31.21 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  31.76 
 
 		 428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  36.12 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 		 414 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  36.12 
 
 		 422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  31.65 
 
 		 416 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  30.81 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 425 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>