More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0523 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 424 aa  857    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  49.53 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  50.37 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  48.57 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  47.27 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  39.15 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  40.11 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  36.55 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  36.67 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  40.5 
 
 		 449 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  36.04 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  35.28 
 
 		 379 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  37.19 
 
 		 411 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  34.44 
 
 		 434 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.98 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.79 
 
 		 441 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.06 
 
 		 434 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  33.06 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.06 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  36.29 
 
 		 436 aa  199  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 		 434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  33.15 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  33.06 
 
 		 434 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  33.71 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  32.25 
 
 		 422 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  31.02 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  28.43 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  29.67 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  31.49 
 
 		 443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  28.79 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  33.77 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  31.18 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  31.12 
 
 		 440 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  33.07 
 
 		 453 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  30.89 
 
 		 438 aa  169  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  32.33 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 		 442 aa  167  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  31.91 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  29.38 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  31.7 
 
 		 454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  32.29 
 
 		 422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  32.29 
 
 		 422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  35.1 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.03 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  33.67 
 
 		 446 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  31.47 
 
 		 424 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  32.72 
 
 		 435 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  30.93 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  33.16 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  31.3 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  30.86 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  26.52 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  32.16 
 
 		 438 aa  153  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 446 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  31.09 
 
 		 426 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  29.74 
 
 		 443 aa  152  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.3 
 
 		 429 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  29.46 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  31.23 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  30.7 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  31.25 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  31.23 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  29.92 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2128  glutamyl-tRNA reductase  32.52 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.69 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  30.85 
 
 		 421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  31.83 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  27.87 
 
 		 425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  31.83 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  33.06 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0776  glutamyl-tRNA reductase  28.65 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.163428 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  30.34 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 430 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  27.97 
 
 		 423 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  29.68 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  30.62 
 
 		 416 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  31.54 
 
 		 428 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  31.54 
 
 		 428 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  32.08 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  31.77 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  29.92 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  27.01 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.25 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0896  glutamyl-tRNA reductase  31.88 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.583722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  28.53 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0851  glutamyl-tRNA reductase  27.68 
 
 		 426 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  28.85 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  28.22 
 
 		 418 aa  143  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>