More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0317 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
395 aa  798    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0706  glutamyl-tRNA reductase  40.36 
 
 
368 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  36.67 
 
 
443 aa  257  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 
454 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.57 
 
 
464 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  35.91 
 
 
444 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  35.91 
 
 
444 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 
464 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  35.91 
 
 
443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
444 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  36.57 
 
 
443 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
444 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
444 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
444 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
444 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  35.41 
 
 
444 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
444 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
444 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 
443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  34.17 
 
 
436 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 
434 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.41 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  32.42 
 
 
458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  34.73 
 
 
443 aa  219  6e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.25 
 
 
434 aa  219  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  34.77 
 
 
441 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.5 
 
 
434 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  34.17 
 
 
434 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 
436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  32.51 
 
 
434 aa  215  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 
440 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  32.41 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  33.59 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
442 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 
428 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 
428 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  31.75 
 
 
434 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 
446 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
450 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  32.91 
 
 
421 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 
428 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 
458 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  35.38 
 
 
448 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  35.38 
 
 
448 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  32.59 
 
 
430 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.84 
 
 
461 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  31.27 
 
 
440 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  36.92 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  32.81 
 
 
426 aa  200  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  34.41 
 
 
442 aa  199  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  31.55 
 
 
420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  33.59 
 
 
426 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  32.67 
 
 
428 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  32.99 
 
 
434 aa  196  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  35.58 
 
 
411 aa  195  9e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  34.02 
 
 
439 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  32.32 
 
 
432 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  30.81 
 
 
446 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  29.04 
 
 
414 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  31.4 
 
 
453 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  30.56 
 
 
446 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  30.81 
 
 
446 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  31.5 
 
 
426 aa  189  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  33.61 
 
 
464 aa  189  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 
432 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  30.49 
 
 
420 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  29.47 
 
 
425 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  32.05 
 
 
421 aa  187  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  28.5 
 
 
446 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  31.41 
 
 
426 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  28.22 
 
 
435 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1426  glutamyl-tRNA reductase  31.94 
 
 
425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1784  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000104753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.87 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  29.64 
 
 
418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  31.83 
 
 
431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  29.66 
 
 
432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.5 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  30.05 
 
 
451 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  29.64 
 
 
418 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  30.87 
 
 
421 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  31.33 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  31.76 
 
 
425 aa  180  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  34.35 
 
 
432 aa  180  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  31.19 
 
 
416 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  33.84 
 
 
432 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
422 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  31.33 
 
 
422 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.44 
 
 
429 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  31.03 
 
 
419 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  32.04 
 
 
428 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
418 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  27.95 
 
 
446 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  31.07 
 
 
422 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1795  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 
425 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  30.69 
 
 
428 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  30.5 
 
 
423 aa  176  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>