More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1784 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1784  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 413 aa  851    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000104753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1368  glutamyl-tRNA reductase  39.85 
 
 		 403 aa  279  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1274  Tetrapyrrole biosynthesis, glutamyl-tRNA reductase-like protein  37.57 
 
 		 336 aa  226  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2525  glutamyl-tRNA reductase  35.35 
 
 		 331 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  28.35 
 
 		 464 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  27.55 
 
 		 428 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  28.01 
 
 		 464 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  26.77 
 
 		 418 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  27.02 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  28.12 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  29.68 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.41 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  26.97 
 
 		 458 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  26.24 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  25.97 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  26.98 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  29.4 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  25.36 
 
 		 428 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  28.38 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  29.57 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  27.79 
 
 		 441 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  28.85 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  28.37 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  28.4 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  27.51 
 
 		 450 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  27.2 
 
 		 440 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  27.95 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  29.39 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  27.84 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  34.88 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  29.39 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  25.41 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  25.99 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  25.54 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  25.69 
 
 		 443 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  25.54 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  27.88 
 
 		 442 aa  136  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.2 
 
 		 423 aa  136  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  26.86 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  24.94 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03645  glutamyl-tRNA reductase  25.93 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  27.91 
 
 		 382 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 432 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  25.13 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1690  glutamyl-tRNA reductase  30.06 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.163075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  27.25 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  25.07 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  25.88 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  27.13 
 
 		 431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  25.45 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  28.03 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  26.27 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  25.34 
 
 		 434 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  28.9 
 
 		 442 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  26.9 
 
 		 443 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  25.34 
 
 		 434 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  27.93 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1456  glutamyl-tRNA reductase  27.01 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1424  glutamyl-tRNA reductase  29.48 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.778377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  28.48 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3752  glutamyl-tRNA reductase  27.3 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  26.51 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  26.65 
 
 		 465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  26.57 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  31.1 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  30.26 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0706  glutamyl-tRNA reductase  24.87 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  26.27 
 
 		 432 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  27.67 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  28.06 
 
 		 428 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1892  glutamyl-tRNA reductase  28.72 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.16 
 
 		 419 aa  126  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  25.13 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  28.94 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  26.45 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  27.98 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  28.94 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  27.99 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  31.65 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  26.21 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  24.8 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0942  glutamyl-tRNA reductase  26.72 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  27.65 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  26.45 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  29.93 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  27.22 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  26.7 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  27.76 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  24.87 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  24.87 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  24.87 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  24.87 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  24.87 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  24.87 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  29.08 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  23.73 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  25.97 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  25.97 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>