More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1690 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1690  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 400 aa  800    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.163075  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1424  glutamyl-tRNA reductase  97.75 
 
 		 400 aa  763    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.778377  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1195  glutamyl-tRNA reductase  34.84 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  29.71 
 
 		 436 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  27.86 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  27.9 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  30.77 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  30.12 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  29.27 
 
 		 464 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  30.62 
 
 		 450 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  27.54 
 
 		 465 aa  155  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  28.05 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  26.38 
 
 		 419 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  27.55 
 
 		 426 aa  152  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  27.75 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  26.36 
 
 		 439 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1051  glutamyl-tRNA reductase  30.86 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00451156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  27.47 
 
 		 418 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  27.47 
 
 		 418 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  26.99 
 
 		 458 aa  149  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  27.47 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  28.26 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  29.6 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  28.09 
 
 		 340 aa  147  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  26.1 
 
 		 422 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 418 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  28.16 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  27.86 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  27.52 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  28.29 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  25.84 
 
 		 455 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  28.11 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  25.93 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  29.33 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  27.16 
 
 		 446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0764  glutamyl-tRNA reductase  29.14 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.014297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  25.52 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  27.34 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  26.04 
 
 		 420 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  27.54 
 
 		 434 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  27.01 
 
 		 420 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  27.83 
 
 		 430 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  27.01 
 
 		 420 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1456  glutamyl-tRNA reductase  27.5 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  23.87 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  27.84 
 
 		 421 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  27.51 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  27.07 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  26.24 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  24.7 
 
 		 456 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  25.13 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  27.46 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2128  glutamyl-tRNA reductase  27.19 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  27 
 
 		 428 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  25.9 
 
 		 418 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  26.37 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  25.53 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  28.43 
 
 		 440 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  25.52 
 
 		 420 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  28.02 
 
 		 443 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  28.38 
 
 		 442 aa  136  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  25.86 
 
 		 418 aa  135  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0706  glutamyl-tRNA reductase  29.23 
 
 		 368 aa  135  9e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  31.76 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2180  glutamyl-tRNA reductase  26.15 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00403267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.69 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  27.07 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  25.74 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  26.96 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  25.74 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  27.16 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  31.45 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  23.74 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  28.45 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  25.48 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1784  glutamyl-tRNA reductase  29.77 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000104753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  25.44 
 
 		 426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0770  glutamyl-tRNA reductase  26.14 
 
 		 435 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  27.3 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.2 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  25.74 
 
 		 425 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  25.83 
 
 		 434 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  26.1 
 
 		 422 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  25.96 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  27.55 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  33.45 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>