More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0844 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  81.36 
 
 		 447 aa  695    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  81.36 
 
 		 447 aa  695    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  81.36 
 
 		 447 aa  695    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  88.6 
 
 		 455 aa  807    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 456 aa  898    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  76.78 
 
 		 468 aa  633  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  61.3 
 
 		 445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  62.03 
 
 		 457 aa  508  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  55.48 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  56.12 
 
 		 438 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  52.38 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  50.9 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  51.7 
 
 		 434 aa  385  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  51.61 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  49.2 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  46.64 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  50.69 
 
 		 455 aa  355  6.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  48.48 
 
 		 473 aa  349  6e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  50.82 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  44.6 
 
 		 501 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  50.46 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  48.28 
 
 		 430 aa  329  8e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  45.35 
 
 		 456 aa  312  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  42.95 
 
 		 473 aa  312  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  46.02 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  47.88 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  34.89 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.57 
 
 		 436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  37.94 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  35.36 
 
 		 434 aa  251  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34.46 
 
 		 443 aa  249  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  33.03 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  31.8 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  34.19 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  33.95 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 		 434 aa  237  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 458 aa  235  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.91 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  37.64 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  33.88 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  28.4 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.98 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  37.06 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 441 aa  221  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  28.34 
 
 		 444 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 		 414 aa  219  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  33.93 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 440 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  27.88 
 
 		 444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  27.88 
 
 		 444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  37.18 
 
 		 425 aa  216  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  30.65 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  30.65 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  28.4 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  31.94 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  31.86 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  30.47 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  36.84 
 
 		 473 aa  207  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 419 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  34.98 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  31.93 
 
 		 420 aa  205  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  31.19 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  31.31 
 
 		 428 aa  203  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  31.07 
 
 		 431 aa  204  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  31.4 
 
 		 450 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  34.02 
 
 		 438 aa  202  8e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  30.61 
 
 		 428 aa  199  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  36.81 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  29.2 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  36.66 
 
 		 446 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  32.65 
 
 		 443 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 		 422 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.48 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  29.79 
 
 		 426 aa  195  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  32.95 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  30.36 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>