More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0706 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0706  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 368 aa  736    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  40.36 
 
 		 395 aa  262  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  32.58 
 
 		 464 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  27.51 
 
 		 422 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 443 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 		 446 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  28.4 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 440 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  30.11 
 
 		 464 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  29.25 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  31.99 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  26.77 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  31.18 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  31.72 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  30.22 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  31.32 
 
 		 436 aa  162  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  28.41 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  27.72 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  27.3 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1021  Glutamyl-tRNA reductase  36 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  29.83 
 
 		 438 aa  159  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  29.53 
 
 		 450 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  28.17 
 
 		 434 aa  159  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 446 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  28.14 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  28.17 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  28.02 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  31.51 
 
 		 428 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  25.63 
 
 		 432 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  25.38 
 
 		 432 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  25.63 
 
 		 432 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  25.63 
 
 		 432 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0137  glutamyl-tRNA reductase  27.18 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0618199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  29.34 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  27.57 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  32.18 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  28.03 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  26.26 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  29.29 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  25.38 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  30.21 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  28.21 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0149  glutamyl-tRNA reductase  27.91 
 
 		 449 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.859015  normal  0.0610884 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  31.58 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  27.25 
 
 		 446 aa  152  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  27.93 
 
 		 426 aa  152  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  25 
 
 		 428 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  30.22 
 
 		 444 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  30.47 
 
 		 444 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  27.32 
 
 		 449 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  30.47 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  30.47 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  30.47 
 
 		 444 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  24.82 
 
 		 434 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  30.47 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  30.47 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  24.75 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  25.38 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  31.79 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  31.79 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  26.57 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  27.81 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  27.86 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  32.08 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  26.52 
 
 		 418 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  29.6 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  29.67 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  25.44 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  30.22 
 
 		 428 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  28.5 
 
 		 428 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  28.5 
 
 		 428 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  26.07 
 
 		 438 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.2 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  30.72 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3145  glutamyl-tRNA reductase  26.46 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0225946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2797  glutamyl-tRNA reductase  26.46 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  24.27 
 
 		 450 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 434 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  27.41 
 
 		 434 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  29.68 
 
 		 443 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  27.55 
 
 		 426 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  31.8 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  29.8 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  29.01 
 
 		 432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  25.97 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  29.8 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  28.85 
 
 		 458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2900  glutamyl-tRNA reductase  25.18 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>