More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0049 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 411 aa  824    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  55.72 
 
 		 449 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  54.57 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  39.24 
 
 		 446 aa  256  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  38.35 
 
 		 423 aa  255  8e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.02 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  43.23 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  43.96 
 
 		 382 aa  252  7e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  42.99 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  37.93 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  38.46 
 
 		 464 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  36.92 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  43.95 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  37.31 
 
 		 425 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  40.51 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.52 
 
 		 464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.77 
 
 		 441 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  36.11 
 
 		 424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  36.25 
 
 		 444 aa  239  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  38.54 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  33.98 
 
 		 420 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  37.03 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  35.5 
 
 		 443 aa  236  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  37.19 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  35.93 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  35.54 
 
 		 447 aa  229  5e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  35.68 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 		 425 aa  222  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  34.21 
 
 		 421 aa  222  9e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 		 434 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  34.53 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  35.44 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  35.52 
 
 		 438 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  34.72 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  34.96 
 
 		 446 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  34.47 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  34.44 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  31.6 
 
 		 458 aa  217  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  35.26 
 
 		 432 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  32.69 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  34 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  35.77 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  32.84 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  34.46 
 
 		 450 aa  213  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  40.48 
 
 		 340 aa  212  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  32.77 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  33.01 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  34.14 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  32.22 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  34.03 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  33.77 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  34.41 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  32.29 
 
 		 420 aa  210  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  33.77 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 		 459 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.01 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  34.01 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  34.6 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.84 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  32.84 
 
 		 434 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  35.2 
 
 		 426 aa  206  8e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  34.18 
 
 		 454 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  32.66 
 
 		 418 aa  205  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  32.42 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  32.3 
 
 		 442 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  32.99 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  32.22 
 
 		 425 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  33.9 
 
 		 424 aa  202  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  31.83 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  32.54 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  35.58 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  34.44 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  33.91 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  32.9 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.11 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  32.29 
 
 		 426 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  32.84 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 431 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  32.34 
 
 		 444 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  32.34 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  32.34 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  32.34 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  32.34 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  32.72 
 
 		 418 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.07 
 
 		 423 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>