More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1728 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 425 aa  865    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  62.35 
 
 		 424 aa  509  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  60.58 
 
 		 423 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  57.11 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  48.57 
 
 		 424 aa  395  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  40.7 
 
 		 449 aa  280  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  41.94 
 
 		 422 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  37.31 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  37.6 
 
 		 383 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  36.24 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  33.81 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  34.81 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.85 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  35.4 
 
 		 379 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  35.19 
 
 		 382 aa  216  9e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  34.98 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  34.48 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  34.44 
 
 		 442 aa  210  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 418 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  29.78 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  33.58 
 
 		 430 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 		 446 aa  206  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  32.84 
 
 		 418 aa  206  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  32.44 
 
 		 458 aa  206  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  34.07 
 
 		 440 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  31.72 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  32.84 
 
 		 423 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  31.54 
 
 		 418 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  31.71 
 
 		 450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  35.46 
 
 		 440 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  31.9 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  31.54 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  32.6 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.75 
 
 		 423 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  34.96 
 
 		 443 aa  192  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 		 434 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 426 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 		 458 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  30.56 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  32.45 
 
 		 421 aa  190  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  31.02 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  32.92 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  35.62 
 
 		 447 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  32.92 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  32.92 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  32.92 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  33.66 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  30.27 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 422 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0781  glutamyl-tRNA reductase  32.25 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  32.68 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  32.68 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  32.92 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  30.62 
 
 		 443 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  32.92 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.31 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  32.68 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  32.68 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  32.43 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  32.43 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  32.43 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3663  glutamyl-tRNA reductase  32.11 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  32.43 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  33.01 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  32.52 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0776  glutamyl-tRNA reductase  31.26 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.163428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  32.52 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.23 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  33.58 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0851  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 426 aa  186  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  30.27 
 
 		 419 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  31.3 
 
 		 429 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  32.85 
 
 		 418 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  32.64 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0852  glutamyl-tRNA reductase  31.79 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  32.68 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  32.43 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  32.68 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  27.48 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  32.1 
 
 		 418 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  33.7 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  29.9 
 
 		 422 aa  184  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  30.9 
 
 		 428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  30.77 
 
 		 432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  30.6 
 
 		 414 aa  183  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  30.81 
 
 		 428 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  33 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>