More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2132 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 447 aa  867    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  54 
 
 		 447 aa  425  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 		 444 aa  403  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  54.35 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  50.47 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  40.05 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  39.44 
 
 		 449 aa  280  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  37.93 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  36.39 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  37.13 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  34.22 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  31.63 
 
 		 458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  36.89 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 420 aa  196  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  34.51 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  34.68 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  32.26 
 
 		 419 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  33.23 
 
 		 379 aa  190  5e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  29.95 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  35.73 
 
 		 436 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 		 441 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  35.62 
 
 		 425 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  32.32 
 
 		 454 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  33.81 
 
 		 416 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 		 443 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  32.93 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  36.5 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  35.58 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  32.69 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  30.68 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 		 383 aa  186  7e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  36.15 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  30.46 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  31.81 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  32.3 
 
 		 416 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  32.5 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  34.82 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  33.67 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  32.85 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  35.58 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  32.52 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  32.33 
 
 		 440 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  34.3 
 
 		 425 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  34.3 
 
 		 425 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  34.03 
 
 		 425 aa  179  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 434 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  29.6 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  31.34 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  33.01 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  34.3 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  29.51 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  30.13 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 421 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 		 414 aa  177  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  32.62 
 
 		 416 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  32.62 
 
 		 416 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  32.62 
 
 		 416 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  32.62 
 
 		 416 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  34.34 
 
 		 449 aa  176  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  32.93 
 
 		 446 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  32.62 
 
 		 464 aa  176  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  28.47 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  28.47 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  28.47 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  28.47 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  28.47 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  28.47 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  29.19 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  32.93 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  28.47 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  34.39 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  31.87 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  31.22 
 
 		 420 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  32.65 
 
 		 434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  29.56 
 
 		 436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  34.39 
 
 		 422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  33.88 
 
 		 427 aa  173  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  29.5 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  29.08 
 
 		 443 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  34.74 
 
 		 422 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  33.86 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  37.08 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  33.86 
 
 		 425 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  31.51 
 
 		 440 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  31.58 
 
 		 416 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 		 419 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>