More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1238 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 424 aa  852    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  64.62 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  62.35 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  58.31 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  50.37 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  38.94 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  37 
 
 		 383 aa  253  6e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  40.54 
 
 		 422 aa  249  7e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  34.46 
 
 		 382 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  34.26 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  34.3 
 
 		 379 aa  236  8e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  35.14 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  37.03 
 
 		 411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  33.99 
 
 		 464 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.73 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  32.35 
 
 		 464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  33.89 
 
 		 443 aa  216  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  30.81 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  37.13 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  36.49 
 
 		 440 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  32.59 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  36.89 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 436 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  32.68 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  32.93 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  32.93 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  31.05 
 
 		 434 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  32.3 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  28.22 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  34.35 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  31.82 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  31.54 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  29.93 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  29.9 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  32.69 
 
 		 414 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  30.81 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  34.03 
 
 		 458 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  31.54 
 
 		 434 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  31.54 
 
 		 416 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  31.46 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  30.7 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  33.98 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  32.04 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  32.93 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  31.55 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  30.54 
 
 		 430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  32.1 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  32.45 
 
 		 425 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  36.49 
 
 		 398 aa  182  7e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  32.68 
 
 		 425 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  31.7 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  34.07 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.84 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  32.69 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  33.83 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.55 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  31.27 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  33.83 
 
 		 446 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  30.83 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  32.47 
 
 		 440 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 		 432 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 438 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 		 432 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  31.73 
 
 		 416 aa  179  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  32.04 
 
 		 442 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 		 432 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 		 432 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  31.73 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  31.73 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  34.85 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  31.73 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  31.73 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  33.83 
 
 		 416 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  32.33 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  32.14 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 459 aa  177  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  30.34 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  31.64 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  33.09 
 
 		 418 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  33.17 
 
 		 453 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>