More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0510 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 421 aa  856    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0265  glutamyl-tRNA reductase  43.22 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.090274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  33.9 
 
 		 449 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  37.02 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  36.94 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  36.68 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  30.83 
 
 		 422 aa  224  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  34.55 
 
 		 383 aa  221  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  27.83 
 
 		 443 aa  206  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  29.91 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.76 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  29.56 
 
 		 423 aa  199  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  27.85 
 
 		 465 aa  196  7e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  29.04 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  28.03 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  28.81 
 
 		 428 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  28.81 
 
 		 428 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  27.08 
 
 		 430 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  28.3 
 
 		 434 aa  193  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  29.67 
 
 		 434 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  29.43 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  27.2 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  29.21 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  29.75 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  27.7 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  26.6 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  32.05 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  28 
 
 		 428 aa  186  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  29.15 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  26.86 
 
 		 434 aa  186  9e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  27.08 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  27.58 
 
 		 443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  28.22 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  27.75 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  27.45 
 
 		 424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  28.01 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  29.19 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  28.07 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.96 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  28.07 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  27.01 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  27.23 
 
 		 428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  27.64 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  27.83 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  26.84 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  27.29 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  27.86 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  27.01 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  28.8 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  26.96 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  28.32 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  28.33 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  28.78 
 
 		 422 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  28.83 
 
 		 419 aa  179  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  26.65 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  28.08 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  28.78 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  29.35 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  27.76 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  26.91 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  26.42 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  27.76 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  27.48 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  26.32 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  28.43 
 
 		 424 aa  176  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  27.54 
 
 		 455 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  28.24 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  28.54 
 
 		 432 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  28.24 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  27.03 
 
 		 425 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  27.97 
 
 		 438 aa  176  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  25.64 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  26.54 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0764  glutamyl-tRNA reductase  29.74 
 
 		 428 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.014297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  28.33 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  28.33 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  28.33 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  26.25 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  28.33 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  27.03 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  28.33 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  27.52 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  25.06 
 
 		 458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  27.85 
 
 		 432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  27.03 
 
 		 425 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.83 
 
 		 461 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  27.09 
 
 		 425 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  27.52 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  28.13 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  27.93 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  27.14 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  27.1 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  26.52 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  26.29 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>