More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3246 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 444 aa  863    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  71.55 
 
 		 457 aa  619  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  59.44 
 
 		 447 aa  451  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  55.97 
 
 		 438 aa  408  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  37.02 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  35.19 
 
 		 449 aa  243  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  36.74 
 
 		 411 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 428 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  37.53 
 
 		 441 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 428 aa  206  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  34.74 
 
 		 382 aa  206  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  32.78 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  33.24 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  31.7 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  33.91 
 
 		 443 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  34.93 
 
 		 425 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  36.12 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  35.03 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  32.85 
 
 		 432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  32.66 
 
 		 431 aa  199  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  34.11 
 
 		 425 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 		 428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  34.61 
 
 		 465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  30.91 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26395  predicted protein  33.59 
 
 		 527 aa  197  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  34.16 
 
 		 432 aa  196  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  32.8 
 
 		 428 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  32.8 
 
 		 428 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  34.27 
 
 		 438 aa  196  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  30.62 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  32.41 
 
 		 432 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  33.66 
 
 		 432 aa  193  6e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  34.01 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  32.91 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  31.19 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  33.87 
 
 		 434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 		 436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  31.15 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  30.41 
 
 		 441 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  30.34 
 
 		 441 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  31.83 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  34.13 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  34.7 
 
 		 446 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  32.92 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  30.49 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  32.52 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  30.6 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  34.72 
 
 		 453 aa  187  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  29.93 
 
 		 458 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  33.83 
 
 		 408 aa  186  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 425 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  34.83 
 
 		 458 aa  186  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  30.33 
 
 		 436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  29.65 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  29.46 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.58 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  34.16 
 
 		 464 aa  184  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  29.82 
 
 		 464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  32.24 
 
 		 443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  33.98 
 
 		 446 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  35.16 
 
 		 427 aa  183  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 		 424 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  33.98 
 
 		 446 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  30.48 
 
 		 434 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.84 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  31.65 
 
 		 432 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  31.56 
 
 		 435 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  36.11 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 444 aa  179  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  35.93 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  33.16 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  31.74 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  31.02 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  32.78 
 
 		 440 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.19 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  33 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  27.89 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  32.51 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  32.17 
 
 		 442 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  28.47 
 
 		 424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>