More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2562 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 424 aa  864    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  57.11 
 
 		 425 aa  479  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  58.31 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  57.38 
 
 		 423 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  47.27 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 		 449 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  38.32 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  35.56 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  34.38 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  34.12 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  34.38 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  34.24 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.27 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  33.88 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32.01 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  37.13 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  30.36 
 
 		 458 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  30.22 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  32.41 
 
 		 443 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  30.6 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  31.33 
 
 		 430 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.65 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  32.52 
 
 		 422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  33.01 
 
 		 425 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  34 
 
 		 422 aa  182  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  32.52 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.81 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  32.92 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  31.28 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  31.91 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  31.66 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  32.21 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  30.89 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.63 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  32.75 
 
 		 444 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  31.71 
 
 		 440 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 		 429 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  32.52 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  30.81 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  30.56 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  32.03 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  32.25 
 
 		 447 aa  176  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  31.3 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  31.3 
 
 		 432 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  31.3 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  31.3 
 
 		 432 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  31.3 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  31.3 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  31.3 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  30.56 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  30.56 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  30.85 
 
 		 414 aa  176  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 432 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  29.83 
 
 		 428 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  31.02 
 
 		 419 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 432 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  32.25 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  30.81 
 
 		 432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  31.63 
 
 		 421 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  28.67 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  28.39 
 
 		 421 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  31.85 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  29.4 
 
 		 459 aa  173  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  32.45 
 
 		 439 aa  173  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 434 aa  172  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  30.45 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  32.61 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  31.73 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  29.21 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  31.62 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  30.08 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  30.5 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  30.1 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  30.67 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  29.48 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  32.61 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  32.61 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  32.61 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  29.48 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  32.22 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  32.44 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  32.22 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  30.05 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  32.22 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  32.22 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  34.81 
 
 		 455 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  31.51 
 
 		 418 aa  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  29.64 
 
 		 434 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 418 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  28.37 
 
 		 436 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>