More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1612 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 447 aa  890    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  59.44 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  55.86 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  54 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  56.34 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  36.74 
 
 		 422 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  36.14 
 
 		 449 aa  243  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  35.54 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  34.93 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  34.63 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  34.24 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  31.12 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  33.84 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  34.3 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 464 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  34.35 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2065  glutamyl-tRNA reductase  31.5 
 
 		 431 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 		 464 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0118  glutamyl-tRNA reductase  31.5 
 
 		 413 aa  180  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000526977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  32.04 
 
 		 420 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  31.63 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  33.24 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  34.05 
 
 		 436 aa  177  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  33.7 
 
 		 425 aa  177  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 440 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  30.99 
 
 		 424 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  34.35 
 
 		 441 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  34.65 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  30.37 
 
 		 428 aa  173  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  30.75 
 
 		 424 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  30.39 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  31.82 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  32.97 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  30.29 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  32.35 
 
 		 418 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  32.43 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  31.63 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  32.43 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  32.51 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  31.36 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  33.01 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  30.12 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  28.22 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 		 418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  31.49 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  32.19 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  32.19 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  30.69 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  30.14 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  30.83 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  30.14 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  31.41 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  32.13 
 
 		 446 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  25.33 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  30.2 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  31.37 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  31.37 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  30.2 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  31.37 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  31.37 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 432 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  29.44 
 
 		 441 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  26.8 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  31.62 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  31.25 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  32.2 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  32.34 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  30.55 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  29.21 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  31.5 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  31.8 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  31.58 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  31.69 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  31.97 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  30.47 
 
 		 435 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  31.97 
 
 		 422 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  31.55 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  31.72 
 
 		 446 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  29.09 
 
 		 420 aa  159  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  30.09 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  29.58 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  31.94 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  34.16 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  30.1 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1845  glutamyl-tRNA reductase  30.86 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.346182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  29.05 
 
 		 422 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  33.77 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>