More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1462 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 449 aa  902    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  62.29 
 
 		 422 aa  512  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  55.72 
 
 		 411 aa  450  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  41.16 
 
 		 423 aa  279  9e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  40.7 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  39.44 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  38.94 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  43.1 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  33.9 
 
 		 421 aa  254  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  37.97 
 
 		 424 aa  253  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  37.14 
 
 		 436 aa  249  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  44.09 
 
 		 379 aa  249  8e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  37.83 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  34.86 
 
 		 457 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  36.28 
 
 		 443 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  44.06 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  42.81 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  36.14 
 
 		 447 aa  243  6e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  43.44 
 
 		 382 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  34.95 
 
 		 444 aa  239  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  40.5 
 
 		 424 aa  239  9e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  35.63 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  34.41 
 
 		 432 aa  234  3e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  36.21 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  34.64 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 446 aa  230  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  34.79 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  36.99 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.03 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 		 464 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 432 aa  226  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  32.31 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  35.11 
 
 		 424 aa  223  6e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.45 
 
 		 434 aa  223  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.21 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  34.25 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  36.02 
 
 		 441 aa  221  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  34.84 
 
 		 424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  40.69 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  34.86 
 
 		 446 aa  219  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  34.66 
 
 		 443 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.31 
 
 		 464 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 418 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.75 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  35.37 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  32.78 
 
 		 443 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  32.85 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  35.42 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  34.78 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 416 aa  213  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.88 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  32.48 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  34.96 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  32.17 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  35.61 
 
 		 425 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  34.07 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 421 aa  209  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  34.38 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  34.02 
 
 		 420 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  34.09 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 		 446 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  34.09 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  34.09 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  34.09 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  34.31 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  34.65 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  34.34 
 
 		 416 aa  206  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  32.14 
 
 		 428 aa  206  7e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 		 418 aa  206  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  33.5 
 
 		 418 aa  206  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  34.31 
 
 		 418 aa  206  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  34.32 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 425 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  32.81 
 
 		 434 aa  205  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  34.8 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  34.17 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>