More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1588 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  93.46 
 
 		 382 aa  738    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  90.05 
 
 		 382 aa  716    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  81 
 
 		 379 aa  644    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 382 aa  777    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  57.97 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  36.84 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  43.44 
 
 		 449 aa  239  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  42.99 
 
 		 411 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  36.04 
 
 		 424 aa  233  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  35.14 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  40.41 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  36.94 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  38.51 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.62 
 
 		 464 aa  225  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  38.07 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  38.07 
 
 		 434 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  34.38 
 
 		 424 aa  220  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  38.79 
 
 		 434 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  37.22 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  37.85 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  35.19 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  37.75 
 
 		 434 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 		 444 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.91 
 
 		 441 aa  199  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  32.14 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  34.25 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  35.91 
 
 		 446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  32.96 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  34.24 
 
 		 447 aa  195  9e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  33.7 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  30.31 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  33.61 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  34.49 
 
 		 422 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  33.16 
 
 		 418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  34.1 
 
 		 426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  34.49 
 
 		 419 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  34.2 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  32.95 
 
 		 425 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  32.95 
 
 		 425 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  35.45 
 
 		 458 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  34.71 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  33.24 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  32.99 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.75 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 425 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  32.57 
 
 		 428 aa  186  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  34.4 
 
 		 443 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.99 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  32.92 
 
 		 340 aa  186  7e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  30.46 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  31.9 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  31.46 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  32.25 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  33.24 
 
 		 408 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  31.39 
 
 		 428 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  31.39 
 
 		 428 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.52 
 
 		 442 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  32.43 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  34.05 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  33.14 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  30.46 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  30.85 
 
 		 422 aa  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  32.67 
 
 		 430 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.64 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.02 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  29.6 
 
 		 416 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  30.62 
 
 		 416 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  33.14 
 
 		 425 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  30.87 
 
 		 421 aa  179  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  33.14 
 
 		 425 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  29.6 
 
 		 416 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  31.83 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  31.89 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  32.08 
 
 		 439 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  31.62 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  32.21 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  32.16 
 
 		 459 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  32.17 
 
 		 425 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  33.14 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  32.93 
 
 		 447 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  29.85 
 
 		 416 aa  176  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  31.81 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  30.87 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  30.35 
 
 		 426 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  29.85 
 
 		 416 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  32.66 
 
 		 424 aa  176  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  29.35 
 
 		 416 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  31.44 
 
 		 434 aa  176  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  28.86 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  31.7 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  31.7 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  28.86 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  29.6 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  31.7 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>