More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1845 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1845  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
445 aa  868    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.346182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1969  glutamyl-tRNA reductase  75 
 
 
422 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1994  glutamyl-tRNA reductase  75 
 
 
422 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1884  glutamyl-tRNA reductase  75 
 
 
422 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  37.8 
 
 
436 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  36.73 
 
 
434 aa  260  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  37.77 
 
 
443 aa  254  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 
434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  41.02 
 
 
446 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  35.89 
 
 
434 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  40.78 
 
 
446 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  37.12 
 
 
440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.69 
 
 
434 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  40.53 
 
 
446 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  37.32 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  38.46 
 
 
458 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  34.45 
 
 
434 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 
416 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  35.87 
 
 
421 aa  239  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  36.45 
 
 
442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  40.33 
 
 
440 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34.75 
 
 
443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 
442 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  35.17 
 
 
420 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  37.53 
 
 
436 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  35.7 
 
 
450 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.1 
 
 
461 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  31.26 
 
 
441 aa  227  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  38.64 
 
 
430 aa  227  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 
436 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  34.97 
 
 
443 aa  223  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  38.29 
 
 
424 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  35.03 
 
 
416 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  35.49 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  34.94 
 
 
416 aa  221  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  36.07 
 
 
425 aa  220  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  36.34 
 
 
420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  32.24 
 
 
464 aa  220  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  37.26 
 
 
418 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.83 
 
 
423 aa  219  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  35.53 
 
 
416 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  35.53 
 
 
416 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  35.53 
 
 
416 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  35.53 
 
 
416 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  36.73 
 
 
443 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  36.73 
 
 
443 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  37.59 
 
 
446 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 
432 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 
432 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 
434 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 
434 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 
434 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 
434 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  35 
 
 
422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  34.74 
 
 
426 aa  216  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  31.4 
 
 
434 aa  216  8e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  35.03 
 
 
416 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 
416 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  33.92 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  34.94 
 
 
416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  35.78 
 
 
429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.41 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 
432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  34.33 
 
 
418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 
424 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  34.68 
 
 
416 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  35.34 
 
 
432 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  36.03 
 
 
428 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  36 
 
 
446 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  34.93 
 
 
432 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  35.78 
 
 
428 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 
427 aa  211  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 
424 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3043  glutamyl-tRNA reductase  37.27 
 
 
434 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146578  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  34.94 
 
 
432 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  34.45 
 
 
432 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 
416 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  34.17 
 
 
416 aa  209  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  35.92 
 
 
432 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 
416 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  29.81 
 
 
458 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 
422 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  34.18 
 
 
416 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  31.22 
 
 
443 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  36.1 
 
 
431 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  33.66 
 
 
432 aa  206  9e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  35.82 
 
 
421 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 
426 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 
422 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  33.74 
 
 
438 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  32.5 
 
 
418 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 
422 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  37.04 
 
 
449 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 
439 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  36.57 
 
 
450 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  33.42 
 
 
416 aa  203  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>